免疫沈降・プルダウン（IP/Co-IP）
免疫沈降（IP）は、抗体やタグを使って目的のタンパク質や複合体を選択的に回収する手法です。単独のタンパク質を狙うIPのほか、結合パートナーごと回収して相互作用を調べるCo-IP、DNA結合を見るChIP、そしてタグ親和性を使うプルダウンまで、目的に応じて担体と手順を選びます。担体はProtein A/Gを結合した磁気ビーズとアガロースビーズが中心で、キットには抗体をビーズに共有結合させて溶出時の混入を抑えるタイプもあります。
- 分類
- 免疫沈降・プルダウン（IP/Co-IP）
- 主な用途
- IP / Co-IP / ChIP / プルダウン / 磁気ビーズ
- 代表メーカー
- Thermo Fisher Scientific（Invitrogen）・Thermo Fisher Scientific（Pierce）・Cytiva・Cell Signaling Technology ほか計7社
- 関連キーワード
- Protein A/G / Dynabeads / 磁気ビーズ / クロスリンクIP / ChIP / タグ親和性プルダウン
用途・特徴
担体選びの軸は、まず磁気ビーズかアガロースビーズかです。磁気ビーズは遠心を使わずマグネットで分離できるため操作が速く、非特異的結合を抑えやすい傾向があります。アガロースビーズは多孔質で結合容量が高く、実績も長いので、条件が確立している系では引き続き選ばれています。Protein Aは主にヒトやウサギのIgGに、Protein Gはマウスやラットを含む幅広い動物種のIgGに結合するため、使う一次抗体の由来に合わせて選ぶか、両者を混ぜたProtein A/Gタイプを選びます。
Co-IPで相互作用や翻訳後修飾を解析する場合は、溶出時に抗体の重鎖・軽鎖バンドが目的シグナルに重なる問題が起きがちです。これを避けるには、抗体をビーズにあらかじめ共有結合（クロスリンク）させておくキットが有効で、変性溶出しても抗体断片が混入しにくくなります。ChIPを行う場合は、クロマチンの断片化を酵素消化で行うキットとソニケーションで行うキットがあり、酵素消化はばらつきを抑えやすい選択肢です。
- 磁気ビーズは遠心不要で操作が速く、非特異的結合を抑えやすい
- アガロースビーズは結合容量が高く、確立した系での実績が長い
- Protein AとGは対応するIgGの動物種が異なり、A/G混合型もある
- クロスリンクキットは溶出時の抗体断片混入を抑えられCo-IPに有利
- ChIPは酵素消化とソニケーションで断片化方式を選べる
- タグ親和性ビーズを使えば抗体なしでタグ融合タンパク質をプルダウンできる
使用方法
IP・Co-IPの標準的な流れは、担体と抗体を選び、ライセートと反応させて磁気またはビーズで回収し、溶出して下流解析にかけるという手順です。
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掲載情報の確認日：2026年7月（メーカー公開情報をもとに編集部が確認。最新・正確な仕様は各社公式をご確認ください）