オリゴ脱保護試薬（アンモニア・フッ化物）

RNAでは塩基・リン酸の脱保護に加えて2'-水酸基の保護基除去が必要になる。2'-O-TBDMS保護では、フッ化物源であるTEA·3HF（トリエチルアミン三フッ化水素酸塩）やTBAF（フッ化テトラブチルアンモニウム）でSi-O結合を切断する。TEA·3HFはガラスを侵しにくくほぼ中性で、DMSO等の共溶媒中65℃で脱シリル化する手順が定着している。2'-O-TOM保護ではフッ化物処理の条件が異なり、保護基化学と脱保護試薬は一体で選ぶ。

選定軸は、保護基化学との整合・処理時間と温度・修飾核酸やラベルの安定性・スケールと安全性に整理できる。蛍光色素や塩基修飾を含む配列では、より穏和なAPAやK2CO3/メタノール、室温脱保護などの代替条件を検討する。脱保護は副反応（脱プリン、N-アシル残留、2'脱保護不全）と直結するため、試薬グレード・含水率・新鮮さの管理が品質に効く。GMP製造ではアンモニア・フッ化物の取り扱い安全性と廃液処理も含めて工程設計する。