鋳型DNAの直鎖化
環状プラスミド鋳型を制限酵素で直鎖化し、ラントオフ転写で全長mRNAを得る前処理に使う。
- 鋳型前処理
- 直鎖化
IVT用酵素・試薬は、mRNA医薬の核となるin vitro転写(IVT)反応を構成する原材料群です。鋳型DNAから一本鎖RNAを合成するT7 RNAポリメラーゼ、基質となるNTP(修飾NTPを含む)、環状鋳型を直鎖化する制限酵素、転写後に鋳型DNAを除去するDNaseなどを含みます。配列正確性・収量・不純物プロファイルを左右し、GMPグレードと性能が選定の鍵になります。
IVT反応は、直鎖化した鋳型DNAのT7(またはSP6・T3)プロモーター下流をRNAポリメラーゼが転写し、NTPを基質に一本鎖RNAを合成する反応です。N1-メチルシュードウリジン(m1Ψ)などの修飾NTPを用いると、免疫原性の低減と翻訳効率の向上が期待できます。酵素・試薬の品質が、全長収量、二本鎖RNA(dsRNA)副生成物、中断配列、残存DNAといった不純物プロファイルを直接左右します。
選定では、グレード(研究用/GMP)、エンドトキシン・ヌクレアーゼ・残存宿主由来不純物の規格、酵素の比活性とロット間再現性、修飾NTPの取り込み効率、鋳型直鎖化に使う制限酵素の認識配列とスター活性、DNaseの完全分解性とRNAへの影響を確認します。トレーサビリティとDMF・規格書などの規制サポートも重要です。
工程設計では、IVT反応条件(酵素・NTP・Mg2+・温度・時間)の最適化に加え、Cappingストラテジー(共転写キャップ vs 酵素的キャップ)との整合、転写後のDNase処理とその後の精製(dsRNA除去・NTP/酵素除去)まで一連で考えます。連続生産や大スケールでは、原材料の供給安定性とコストも設計要素になります。
基本的には、鋳型DNAを直鎖化し、T7 RNAポリメラーゼとNTPでIVT反応を行い、DNase処理後に精製してmRNAを回収します。
IVT用酵素・試薬は、mRNA原薬製造の上流工程と品質設計で中心的に使われます。
環状プラスミド鋳型を制限酵素で直鎖化し、ラントオフ転写で全長mRNAを得る前処理に使う。
T7 RNAポリメラーゼとNTP(修飾NTP含む)を用いてmRNAを合成する中核反応に使う。
DNaseで残存鋳型DNAを分解し、残存DNA規格を満たすための除去に使う。
酵素・NTP・Mg2+・反応条件を調整し、収量・全長率・dsRNAなどを最適化する検討に使う。
IVT用酵素・試薬は、mRNAやIVT由来RNAを用いるモダリティーで特に重要です。