掲載メーカー23社Thermo Fisher Scientific / Applied Biosystems・Promega・Takara Bio ほか
掲載製品44製品6つの種類に分けて掲載
使う工程11工程細胞株開発・クローン選抜・遺伝子導入・安定発現株作製・セルバンク
関連モダリティ14種抗体医薬・ADC・二重特異性抗体
要点
- 特定領域のDNA配列を確認できる
- プラスミド確認、クローニング確認、PCR産物確認に使われる
- CRISPR編集部位や変異導入部位の確認に使われる
- Sanger反応後にキャピラリー電気泳動で配列を読む
メーカーと製品
23社・44製品メーカー製品特徴問い合わせ
Sangerシーケンス装置・キャピラリー電気泳動装置7製品
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsSeqStudio Genetic AnalyzerSangerシーケンスとフラグメント解析に対応するベンチトップ型キャピラリー電気泳動装置。低〜中スループットの配列確認に使われる。公式サイト Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsSeqStudio Flex Genetic AnalyzerSangerシーケンスとフラグメント解析に対応するSeqStudioシリーズの拡張モデル。複数キャピラリー構成でスループットに応じて選択できる。公式サイト Thermo Fisher Scientific / Applied Biosystems3500 Genetic Analyzer8キャピラリー構成の遺伝子解析装置。Sangerシーケンス、フラグメント解析、STR解析に使われる。公式サイト Thermo Fisher Scientific / Applied Biosystems3500xL Genetic Analyzer24キャピラリー構成の遺伝子解析装置。Sangerシーケンスやフラグメント解析のハイスループット運用に使われる。公式サイト Thermo Fisher Scientific / Applied Biosystems3730xl DNA Analyzerハイスループットのキャピラリー電気泳動装置。大量のSangerシーケンスやフラグメント解析に使われる。公式サイト PromegaSpectrum Compact CE SystemSangerシーケンスとフラグメント解析に対応するベンチトップ型キャピラリー電気泳動装置。公式サイト PromegaSpectrum CE SystemSTR解析やフラグメント解析に使われるキャピラリー電気泳動装置。Sangerシーケンスには対応しない(Sangerは小型のSpectrum Compact CE System)。公式サイト Sangerシーケンス試薬8製品
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsBigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing KitSangerシーケンス用の代表的なサイクルシーケンスキット。PCR産物、プラスミド、fosmid、BACテンプレートなどの配列確認に使われる。公式サイト 残りの36製品を見る
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsBigDye Terminator v1.1 Cycle Sequencing Kit短いPCR産物や特定用途のSangerシーケンス反応に使われるサイクルシーケンスキット。公式サイト Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsBigDye Direct Cycle Sequencing KitPCRとシーケンスを簡略化するためのSangerシーケンス関連キット。PCR産物の直接シーケンスに使われる。公式サイト Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsBigDye XTerminator Purification KitBigDye反応後の精製に使われるキット。キャピラリー電気泳動前の反応クリーンアップに使われる。公式サイト Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsExoSAP-IT PCR Product Cleanup ReagentPCR産物中のプライマーやdNTPを分解し、Sangerシーケンス前処理に使われるクリーンアップ試薬。公式サイト PromegaGoTaq DNA Polymerase / PCR Master MixesSanger前処理PCRや配列確認用PCRに使われるPCR試薬。公式サイト Takara BioPrimeSTAR / Ex Taq / PCR試薬Sanger前処理PCR、クローニング確認、配列確認用PCRに使われる試薬。公式サイト NEBQ5 High-Fidelity DNA Polymerase高正確性PCRに使われるDNAポリメラーゼ。シーケンス前処理やクローニング確認に使われる。公式サイト PCR産物・シーケンス反応精製5製品
Beckman Coulter Life SciencesAgencourt CleanSEQSangerシーケンス反応産物の精製に使われる磁気ビーズベースのクリーンアップ試薬。公式サイト Cytivaillustra ExoProStar / GFX PCR DNA and Gel Band Purification KitPCR産物やDNA断片の精製に使われる製品群。Sanger前処理で使われる。公式サイト QIAGENQIAquick PCR Purification KitPCR産物の精製に使われるカラムキット。Sangerシーケンス前処理に使われる。公式サイト PromegaWizard SV Gel and PCR Clean-Up SystemPCR産物やゲル抽出DNAの精製に使われるキット。公式サイト NEBMonarch PCR & DNA Cleanup KitPCR産物やDNA断片の精製に使われるキット。公式サイト 解析ソフト・データ管理8製品
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsSequencing Analysis SoftwareSangerシーケンスデータのベースコールやクロマトグラム確認に使われるソフトウェア。公式サイト Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsSeqScape SoftwareSangerシーケンスデータのアライメント、変異確認、配列比較に使われるソフトウェア。公式サイト Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsVariant Reporter SoftwareSangerシーケンスデータの変異確認やレポート作成に使われるソフトウェア。公式サイト GeneiousGeneious PrimeSanger、NGS、クローニング、配列アライメント、プラスミドマップ作成に使われる解析ソフト。公式サイト SnapGeneSnapGeneプラスミドマップ、配列確認、クローニング設計、Sangerトレースとの照合に使われるソフトウェア。公式サイト DNASTARLasergeneSanger、NGS、配列アライメント、変異解析、クローニング確認に使われるソフトウェア。公式サイト BenchlingBenchling Platform配列管理、プラスミド設計、実験記録、サンプル管理に使われるクラウドプラットフォーム。公式サイト Thermo Fisher ScientificSampleManager LIMSシーケンス結果、サンプル情報、品質試験データ管理に使われるLIMS。公式サイト サーマルサイクラー・PCR前処理7製品
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsVeritiPro Thermal CyclerPCR増幅やサイクルシーケンス反応に使われるサーマルサイクラー。温度制御、接続性、96ウェル構成に対応する。公式サイト Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsSimpliAmp Thermal CyclerコンパクトなPCRサーマルサイクラー。Sanger前処理PCRやサイクルシーケンス反応に使われる。公式サイト Bio-RadT100 Thermal Cycler96ウェル対応のコンパクトなサーマルサイクラー。PCR条件検討やSanger前処理に使われる。公式サイト Bio-RadC1000 Touch Thermal Cycler交換式ブロックに対応するサーマルサイクラー。PCR増幅や条件検討に使われる。公式サイト EppendorfMastercycler X50高速ランプレート、2Dグラジエント機能、ネットワーク接続に対応するサーマルサイクラー。公式サイト Takara BioTaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Touch国内向けのPCRサーマルサイクラー。グラジエント機能やタッチパネル操作に対応する。公式サイト Analytik JenaBiometra TAdvanced高性能サーマルサイクラー。交換式ブロックやグラジエント機能に対応する。公式サイト 受託解析サービス9製品
Eurofins GenomicsDNAシーケンスサービス国内向けのSanger DNAシーケンス受託サービス。解析結果は最短でサンプル到着日に報告されるサービスとして案内されている。公式サイト Azenta Life Sciences / GENEWIZSanger SequencingDNA配列決定の受託サービス。プラスミド、PCR産物、未精製PCR産物、コロニーなどに対応する。公式サイト FasmacDNAシーケンス解析国内向けのSangerシーケンス受託サービス。プラスミド、PCR産物、フラグメント解析などに対応する。公式サイト Takara BioDNAシーケンス解析サービス国内向けのDNAシーケンス受託解析サービス。研究・開発用途の配列確認に使われる。公式サイト MacrogenSanger SequencingSangerシーケンス、NGS、遺伝子解析などの受託解析サービスを提供する。公式サイト MicrosynthSanger SequencingSangerシーケンス、フラグメント解析、細胞株認証関連解析に対応する受託サービス。公式サイト GenScriptSanger SequencingSangerシーケンス、遺伝子合成、プラスミド構築、配列確認に関係するサービスを展開。公式サイト Quintara BiosciencesSanger Sequencing研究向けSangerシーケンス受託サービス。プラスミドやPCR産物の配列確認に使われる。公式サイト PlasmidsaurusPlasmid SequencingNanoporeベースの全長プラスミドシーケンスが中心だが、プラスミド配列確認の受託候補として比較される。公式サイト 詳しく見る
用途・特徴
特定のPCR産物やプラスミド、挿入配列、変異部位などを狙って確認する用途に向いています。
Sangerシーケンスは、特定のDNA領域の配列を高い信頼性で確認するために使われます。PCRで増幅した領域やプラスミドDNAをテンプレートとして、サイクルシーケンス反応を行い、反応産物をキャピラリー電気泳動で分離して配列を読み取ります。
基本的には、確認したいDNA領域をPCRで増幅し、PCR産物またはプラスミドをテンプレートとしてサイクルシーケンス反応を行います。
4シーケンスプライマーを準備する
5BigDyeなどのSangerシーケンス試薬で反応する 実際の条件は、テンプレートの種類、PCR産物サイズ、プライマー設計、GC含量、反復配列、シーケンス長、解析目的、受託解析の有無によって変わります。
SangerシーケンスとNGSは、どちらもDNA配列を読む技術ですが、向いている用途が異なります。
結論Sangerシーケンスは「狙った配列を確認する技術」、NGSは「広く大量に読む技術」と考えるとわかりやすくなります。
NGSSangerシーケンス
主な対象
多数領域、全ゲノム、トランスクリプトーム、メタゲノム
主な用途
外来性ウイルス検出、変異解析、網羅解析、細胞株特性解析
| 項目 | 内容 |
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| Sangerシーケンス | DNA配列を読む解析法 |
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| キャピラリー電気泳動 | Sanger反応産物を分離・検出する装置技術 |
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| 主な用途 | 配列確認、クローニング確認、変異確認 |
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| 関連装置 | Genetic Analyzer、Spectrum Compact CEなど |
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| 関連試薬 | BigDye Terminator、サイクルシーケンス試薬など |
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| 項目 | 通常PCR | Sangerシーケンス |
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| 主な目的 | DNAを増幅する | DNA配列を読む |
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| 使用装置 | サーマルサイクラー | サーマルサイクラー+キャピラリー電気泳動装置 |
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| 結果 | PCR産物の有無やサイズ | 塩基配列 |
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| 主な確認方法 | ゲル電気泳動、フラグメント解析 | クロマトグラム、配列データ |
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| 向く用途 | インサート確認、遺伝子確認 | 配列確認、変異確認、編集確認 |
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| 用途 | 内容 | 主な場面 |
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| プラスミド配列確認 | クローニングしたプラスミドの挿入配列を確認する | mRNA鋳型、AAVプラスミド、発現ベクター |
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| クローニング確認 | インサート配列や変異導入部位を確認する | 細胞株開発、遺伝子導入、研究開発 |
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| PCR産物確認 | PCRで増幅した目的領域の配列を確認する | 遺伝子確認、細胞同一性、変異確認 |
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| CRISPR編集確認 | 編集部位周辺の配列を確認する | 遺伝子編集、細胞株構築 |
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| 細胞同一性確認 | 特定遺伝子やSTR周辺の確認に使われる場合がある | セルバンク、細胞株確認 |
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| 変異確認 | 点変異、挿入、欠失を確認する | 変異導入、クローン確認 |
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| ウイルスベクター確認 | ベクター配列や挿入配列を確認する | AAV、レンチウイルス、遺伝子治療 |
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| 菌株・プラスミド確認 | 大腸菌コロニーやプラスミドの配列確認 | プラスミドDNA製造、微生物発酵 |
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運用形態自社解析か、受託解析か
サンプル数少数サンプルか、多数サンプルか
テンプレートPCR産物、プラスミド、BAC、コロニー、未精製サンプルなど
読み取り長必要なリード長、配列品質
難読配列GCリッチ、反復配列、二次構造に対応できるか
装置SeqStudio、3500、Spectrum Compact CEなど
試薬BigDye、サイクルシーケンス試薬、精製試薬
前処理PCR、PCR産物精製、シーケンス反応精製
解析ソフトクロマトグラム確認、アライメント、変異確認
GMP対応試験法、データ記録、監査証跡、LIMS連携の要否
コスト装置、保守、試薬、受託費用、ランニングコスト
サポート国内保守、受託解析の納期、トラブル時対応
抗体原薬用発現ベクターCHO細胞
抗体部分の遺伝子構築確認で関係する。
発現ベクター配列確認細胞株開発
組換えタンパク質の遺伝子配列確認に使われる。
プラスミドITR周辺導入遺伝子
AAVプラスミドやベクター構築確認に使われる。
ベクター構築導入配列パッケージング関連確認
遺伝子治療・細胞治療ベクターの確認に関係する。
プラスミド構築インサート変異確認
mRNAやAAV原料の配列確認に使われる。
プラスミド鋳型Linear DNA
mRNA合成前のテンプレート配列確認に関係する。
細胞基材ウイルスシード配列確認
構築物やウイルス関連配列確認に使われる。
掲載情報の確認日:2026年7月(メーカー公開情報をもとに編集部が確認。最新・正確な仕様は各社公式をご確認ください)