掲載メーカー39社Illumina・Thermo Fisher Scientific / Ion Torrent・MGI Tech ほか
掲載製品69製品8つの種類に分けて掲載
使う工程11工程細胞株開発・クローン選抜・遺伝子導入・安定発現株作製・セルバンク
関連モダリティ14種抗体医薬・ADC・二重特異性抗体
要点
- DNA/RNA配列を大量に並列解析できる
- 外来性ウイルス検出やセルバンク特性解析に使われる
- 既知・未知のウイルスや微生物を広く探索できる
- AAV、レンチウイルス、細胞治療、遺伝子編集で重要
メーカーと製品
39社・69製品メーカー製品特徴問い合わせ
ショートリードNGSシーケンサー9製品
IlluminaNovaSeq X Series生産スケール・超ハイスループット解析向けのNGSシステム。全ゲノム、深いシーケンス、外来性因子解析など大規模解析で使われる。公式サイト IlluminaNextSeq 1000 / NextSeq 2000中〜ハイスループットのベンチトップNGSシステム。ターゲットシーケンス、RNA-seq、メタゲノム解析などに使われる。公式サイト IlluminaMiSeq i100 Series小型ベンチトップNGSシステム。小規模ラボやターゲットパネル、迅速解析用途で使われる。公式サイト IlluminaMiSeq Systemベンチトップ型NGSシステム。アンプリコンシーケンス、微生物解析、ターゲット解析などに使われる。公式サイト IlluminaiSeq 100 System小型ベンチトップNGSシステム。少数サンプルのシーケンス、教育・研究用途、ターゲット解析で使われる。公式サイト Thermo Fisher Scientific / Ion TorrentIon Torrent Genexus Systemサンプル精製、定量、ライブラリー調製、シーケンス、解析、レポート作成を自動化するNGSプラットフォーム。短いターンアラウンドが必要な解析で使われる。公式サイト Thermo Fisher Scientific / Ion TorrentIon GeneStudio S5 System半導体シーケンス技術を用いたIon Torrent NGSシステム。ターゲットシーケンス、感染症、がん研究、微生物解析などに使われる。公式サイト MGI TechDNBSEQ-G400DNBSEQ技術を用いたベンチトップ〜中規模向けNGSシステム。ゲノム、トランスクリプトーム、ターゲット解析で使われる。公式サイト 残りの61製品を見る
MGI TechDNBSEQ-T20x2 / DNBSEQシリーズ大規模シーケンス向けのDNBSEQプラットフォーム。大量データが必要なゲノム解析や大規模研究で使われる。公式サイト ロングリードNGSシーケンサー7製品
Oxford Nanopore TechnologiesMinION Mk1B / Mk1C小型・ポータブルなナノポアシーケンサー。リアルタイム長鎖リード解析、迅速確認、小規模解析で使われる。公式サイト Oxford Nanopore TechnologiesGridION複数フローセルを運用できるベンチトップ型ナノポアシーケンサー。長鎖リード解析や中規模解析で使われる。公式サイト Oxford Nanopore TechnologiesPromethION 2 Integrated高出力ナノポアシーケンスを小型装置で実行するシステム。ロングリード解析やマルチオミクス用途で使われる。公式サイト Oxford Nanopore TechnologiesPromethION 24最大24個の高出力PromethIONフローセルを同時運用できる生産スケールのナノポアシーケンサー。公式サイト PacBioRevio SystemHiFiリードによる高精度ロングリードシーケンスを大規模に実行するシステム。全ゲノム、構造変異、複雑領域解析に使われる。公式サイト PacBioVega Systemベンチトップ型のロングリードシーケンサー。小規模ラボでのHiFiシーケンス利用を想定したシステム。公式サイト PacBioSequel IIe SystemHiFiロングリードシーケンスに使われるシステム。全ゲノム、アンプリコン、複雑配列解析で使われる。公式サイト ライブラリー調製・前処理10製品
IlluminaDNA Prep / RNA Prep / Library Prep KitsIlluminaシーケンサー向けのライブラリー調製キット。全ゲノム、ターゲット、RNA-seqなどに使われる。公式サイト IlluminaNovaSeq X Series Reagent KitsNovaSeq Xシリーズ用の試薬カートリッジ、バッファ、フローセルなどを含むシーケンス試薬。公式サイト Thermo Fisher Scientific / Ion TorrentIon AmpliSeq Library KitsIon Torrentシステム向けのターゲットシーケンス用ライブラリー調製キット。公式サイト Oxford Nanopore TechnologiesLigation Sequencing Kit / Rapid Sequencing Kitナノポアシーケンス用のライブラリー調製キット。ロングリードDNA/RNA解析に使われる。公式サイト PacBioSMRTbell Prep Kit / HiFi Prep KitsPacBio HiFiシーケンス向けのライブラリー調製キット。長鎖DNAの高精度解析に使われる。公式サイト Twist BioscienceTarget Enrichment / NGS Panelsターゲット濃縮、ハイブリダイゼーションキャプチャ、カスタムパネルに使われるNGS関連製品。公式サイト IDTxGen NGS Productsアダプター、プライマー、ターゲットキャプチャ、カスタムパネルなどのNGS関連製品。公式サイト NEBNEBNext Library Prep KitsIlluminaやその他NGSプラットフォーム向けのライブラリー調製キット。公式サイト KAPA / RocheKAPA HyperPrep KitsNGSライブラリー調製、増幅、定量に使われるキット。公式サイト AgilentSureSelect Target Enrichmentターゲット濃縮、エクソーム、カスタムパネルに使われるNGSライブラリー調製ソリューション。公式サイト 核酸抽出・品質確認8製品
Thermo Fisher ScientificKingFisher Flex磁気ビーズベースの自動核酸抽出装置。NGS、PCR、ウイルス検出、細胞株解析の前処理に使われる。公式サイト QIAGENQIAcube Connectカラムベースの核酸抽出を自動化する装置。NGS、PCR、Sanger前処理に使われる。公式サイト PromegaMaxwell Systems磁気ビーズベースの自動核酸抽出装置。細胞、血液、培養サンプルなどからDNA/RNAを抽出する。公式サイト AgilentTapeStation SystemsDNA/RNA、NGSライブラリーのサイズ分布・品質確認に使われる。公式サイト AgilentBioanalyzer SystemsDNA/RNA品質、ライブラリー品質確認に使われるマイクロ流体電気泳動装置。公式サイト AgilentFragment AnalyzerDNA/RNA、NGSライブラリー、フラグメント解析に使われる装置。公式サイト Thermo Fisher Scientific / InvitrogenQubit FluorometerDNA/RNA/タンパク質などの蛍光定量に使われる小型装置。NGSライブラリー定量で使われる。公式サイト PromegaQuantiFluor / Maxwell関連製品核酸定量や前処理に使われる製品群。公式サイト NGS自動化・ライブラリー調製装置8製品
Beckman Coulter Life SciencesBiomek NGeniuS SystemNGSライブラリー調製を自動化するシステム。ライブラリー調製、試薬管理、ワークフロー標準化に使われる。公式サイト Beckman Coulter Life SciencesBiomek i-SeriesNGS前処理、PCRセットアップ、核酸抽出ワークフローの自動化に使われる。公式サイト HamiltonMicrolab STARNGSライブラリー調製、核酸抽出、PCRセットアップに使われる自動分注システム。公式サイト TecanFluent / Freedom EVO NGS WorkstationsNGSライブラリー調製、核酸抽出、プレート分注の自動化に使われる。公式サイト EppendorfepMotionNGS前処理、PCRセットアップ、核酸抽出に使われる自動分注装置。公式サイト RevvitySciclone / JANUS G3NGSライブラリー調製、核酸抽出、分注ワークフローに使われる自動化システム。公式サイト SPT Labtechfirefly / mosquito / dragonfly discoveryNGSライブラリー調製、微量分注、PCRセットアップ、ミニチュア化に使われる。公式サイト MGI TechMGISPシリーズNGSライブラリー調製やサンプル前処理を自動化するMGIのサンプル調製システム。公式サイト バイオインフォマティクス・解析ソフト10製品
IlluminaBaseSpace Sequence HubIlluminaシーケンスデータの管理・解析に使われるクラウド型プラットフォーム。公式サイト IlluminaDRAGEN Bio-IT Platform高速な二次解析に使われるバイオインフォマティクスプラットフォーム。変異解析、ゲノム解析、RNA-seqなどに使われる。公式サイト Thermo Fisher ScientificIon Reporter SoftwareIon Torrentデータの解析に使われるソフトウェア。ターゲットシーケンス、変異解析、レポート作成に使われる。公式サイト Oxford Nanopore TechnologiesEPI2MEナノポアシーケンスデータの解析ワークフローを提供するプラットフォーム。メタゲノム、ウイルス、ヒトゲノムなどの解析に使われる。公式サイト PacBioSMRT LinkPacBioシーケンスデータの解析、HiFi reads生成、アセンブリ、変異解析に使われるソフトウェア。公式サイト QIAGENCLC Genomics WorkbenchNGSデータ解析、RNA-seq、変異解析、微生物解析などに使われるソフトウェア。公式サイト QIAGENIngenuity Pathway Analysis / OmicSoftオミクスデータ解析、パスウェイ解析、トランスクリプトーム解析に使われる。公式サイト DNAnexusDNAnexus Platformクラウド型ゲノムデータ解析・管理プラットフォーム。大規模NGSデータの解析や共同研究に使われる。公式サイト Seven BridgesSeven Bridges Platformクラウド型バイオインフォマティクス解析プラットフォーム。NGSデータ解析、パイプライン管理に使われる。公式サイト PathoQuestNGS-based Biosafety AssaysNGSを用いた外来性ウイルス検出、バイオ医薬品・ワクチン・細胞治療関連の品質試験サービス。公式サイト 受託解析サービス11製品
Eurofins GenomicsNGS Servicesターゲットシーケンス、アンプリコン、全ゲノム、RNA-seqなどに対応する受託NGSサービス。公式サイト Azenta Life Sciences / GENEWIZNGS ServicesAmplicon-EZ、全ゲノム、RNA-seq、ターゲット解析などに対応する受託解析サービス。公式サイト MacrogenNGS Services全ゲノム、エクソーム、RNA-seq、メタゲノムなどの受託NGS解析に対応。公式サイト FasmacNGS受託解析国内向けのNGS受託解析サービス。アンプリコン、メタゲノム、RNA-seqなどに対応。公式サイト Takara Bio受託解析サービスNGS、遺伝子解析、シーケンス関連の国内受託解析サービス。公式サイト Charles RiverNGS Testing for Adventitious Agent DetectionGMP条件下で外来性ウイルス検出や細胞株特性解析に使われるNGSサービス。公式サイト ViruSureNGS Testing for Adventitious Agent DetectionGMP対応のNGS外来性因子検出サービス。既知・未知のウイルス、細菌、マイコプラズマなどの検出に使われる。公式サイト Avance BiosciencesNGS Adventitious Agents Testing既知・未知病原体の検出に使われるNGSベースの外来性因子試験サービス。公式サイト Minaris Advanced TherapiesAgentSCREEN Adventitious Virus Detection by NGS細胞バンクや細胞由来サンプル向けのNGS外来性ウイルス検出サービス。公式サイト NovogeneNGS Services全ゲノム、RNA-seq、メタゲノム、ターゲット解析などの受託NGSサービス。公式サイト BGI GenomicsNGS Services大規模ゲノム解析、RNA-seq、メタゲノムなどの受託解析サービス。公式サイト データ管理・LIMS連携6製品
Thermo Fisher ScientificSampleManager LIMSNGSサンプル、試験依頼、結果、品質データを管理するLIMS。公式サイト LabVantage SolutionsLabVantage LIMSQC試験、サンプル、結果、規格判定、承認フローを管理するLIMS。NGS結果管理にも関係する。公式サイト LabWareLabWare LIMS製薬・バイオ医薬品QCの試験データ管理に使われるLIMS。公式サイト BenchlingBenchling PlatformR&D向けのサンプル管理、実験記録、解析結果管理に使われるクラウドプラットフォーム。公式サイト TetraScienceScientific Data Cloudラボ装置データ、NGSデータ、解析データを統合・標準化するクラウドデータ基盤。公式サイト ScitaraScitara DLXラボ機器、LIMS、ELN、解析アプリケーションを接続するデータ連携プラットフォーム。公式サイト 詳しく見る
用途・特徴
Sangerシーケンスが比較的短い領域を1本ずつ確認する技術であるのに対し、NGSは多数のDNA断片を同時に読み取ることで、ゲノム、トランスクリプトーム、ウイルス、微生物、細胞株、遺伝子編集結果などを広く解析できます。
NGSは、核酸配列を網羅的に解析するために使われます。セルバンクでは、外来性ウイルスや未知のウイルス・微生物の検出、細胞株の由来確認、遺伝学的安定性評価に関係します。
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ウイルスベクター製造では、ベクター配列、残存プラスミド、宿主細胞由来核酸、外来性因子の確認に使われることがあります。遺伝子編集や細胞治療では、編集部位、オフターゲット候補、挿入配列、ベクターコピー、クローン性、細胞由来などの解析にも利用されます。
基本的には、サンプルからDNAまたはRNAを抽出し、ライブラリーを調製して、シーケンサーで配列を読み取ります。その後、解析ソフトやバイオインフォマティクスパイプラインで配列データを解析します。
10ウイルス検出、配列確認、変異解析、細胞株評価などに利用する 実際の条件は、解析目的、サンプル種類、DNA/RNA量、リード長、必要深度、ターゲット範囲、シーケンス方式、解析パイプライン、GMP対応、受託解析の有無によって変わります。
結論Sangerシーケンスは「狙った配列を確認する技術」、NGSは「広く大量に読む技術」と考えるとわかりやすくなります。
SangerシーケンスNGS
主な対象
多数領域、全ゲノム、トランスクリプトーム、メタゲノム
主な用途
外来性ウイルス検出、変異解析、網羅解析、細胞株特性解析
| 項目 | リアルタイムPCR・デジタルPCR | NGS |
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| 主な目的 | 特定配列の検出・定量 | 配列全体や多数ターゲットの解析 |
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| ターゲット | 既知ターゲット中心 | 既知・未知ターゲットの探索が可能 |
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| 定量性 | 高い | 解析設計による |
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| 網羅性 | 限定的 | 高い |
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| 主な用途 | マイコプラズマ、残存DNA、AAV力価、コピー数 | 外来性ウイルス検出、変異解析、ゲノム解析 |
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| 解析負荷 | 比較的小さい | 大きい |
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| 向く場面 | 目的物を素早く測る | 何が含まれるか広く調べる |
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| 項目 | 短鎖リード | 長鎖リード |
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| 主な技術 | Illumina、Ion Torrentなど | Oxford Nanopore、PacBioなど |
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| 読み取り長 | 短い | 長い |
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| 強み | 高精度、高スループット、コスト効率 | 構造変異、長い挿入配列、全長解析に強い |
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| 注意点 | 繰り返し配列や構造解析に弱い場合がある | サンプル品質や解析条件が重要 |
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| 向く用途 | ターゲットパネル、RNA-seq、外来性因子検出 | プラスミド全長、AAVゲノム、構造変異、長鎖RNA |
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| バイオ医薬品での例 | 外来性ウイルス検出、変異解析、QCパネル | ベクター構造確認、長鎖配列確認、複雑な挿入配列解析 |
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| 解析方式 | 内容 | 向く用途 |
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| ターゲットシーケンス | 特定遺伝子や領域を濃縮して解析する | 変異確認、遺伝子編集評価、ウイルス検出 |
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| 全ゲノムシーケンス | ゲノム全体を解析する | 細胞株特性解析、遺伝学的安定性、構造解析 |
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| RNA-seq | RNA発現を網羅的に解析する | 遺伝子発現、細胞状態、分化状態確認 |
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| メタゲノム解析 | サンプル中の微生物・ウイルス核酸を網羅解析する | 外来性ウイルス検出、汚染確認 |
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| アンプリコンシーケンス | PCRで増幅した領域を解析する | 遺伝子編集、変異確認、微生物解析 |
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| ロングリードシーケンス | 長いDNA/RNAを読み取る | プラスミド全長、ベクター構造、AAVゲノム確認 |
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| シングルセルシーケンス | 単一細胞単位で解析する | 細胞集団解析、細胞治療、免疫細胞解析 |
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| 外来性ウイルスNGS | 既知・未知ウイルスを検出する | セルバンク、未精製バルク、細胞治療、ワクチン |
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解析目的外来性ウイルス検出、変異解析、全ゲノム、RNA-seq、AAV解析など
リード長短鎖リードか、長鎖リードか
スループット必要なデータ量、サンプル数、ラン頻度に合うか
精度変異検出や低頻度配列を扱える精度か
ライブラリー調製手動、自動化、キット、必要入力量に対応するか
サンプル種類DNA、RNA、ウイルス、細胞、FFPE、低入力サンプルに対応するか
解析ソフトウイルス検出、変異解析、発現解析、メタゲノム解析に対応するか
データ容量ストレージ、バックアップ、解析環境を確保できるか
GMP対応バリデーション、監査証跡、データインテグリティに対応できるか
受託利用自社運用か、外部受託解析か
コスト装置、試薬、ランコスト、解析費用、保守費用
サポート国内保守、トレーニング、アプリケーション支援の有無
抗体原薬用CHO細胞セルバンク
抗体部分の製造細胞株評価で関係する。
産生細胞セルバンク品質評価
製造細胞や外来性因子評価に使われる。
ベクター配列ゲノム構造外来性因子・残存核酸
AAV品質評価や工程理解で重要。
ベクター構造RCL関連Producer Cell評価
遺伝子治療・細胞治療用ベクターの評価に使われる。
プラスミド全長配列変異確認原材料確認
mRNAやAAV原料の配列確認に関係する。
プラスミド鋳型Linear DNARNA品質・外来性因子
原材料・鋳型DNA・RNA関連解析に使われる。
細胞基材ウイルスシード原液
外来性ウイルス、ウイルス配列、品質確認に使われる。
掲載情報の確認日:2026年7月(メーカー公開情報をもとに編集部が確認。最新・正確な仕様は各社公式をご確認ください)