Makers & Products
NGS のメーカー・製品一覧
関連解析装置・技術
並列シーケンス外来性ウイルス検出網羅解析細胞株特性解析
39社 ・ 69製品
多数の塩基配列を並列に読み取る次世代シーケンサーです。外来性ウイルスの網羅的検出や細胞株の特性解析など、従来法では捉えにくい因子の確認に用いられます。主要37社が関連製品を扱い、スループットや一回あたりの解析規模、ベンチトップ機か生産スケール機かといった処理能力を軸に選びます。
選び方
NGS(次世代シーケンサー=大量の塩基配列を一度に読む技術)は、まず読み方で分かれます。ショートリード(短く正確・低コスト)はゲノムや変異・RNA-seq向き、ロングリード(一本を長く読む)は構造変異や複雑領域・全長解析向き。次にスループット(処理量)と一回あたり単価、必要なターンアラウンド(結果までの時間)で機種を絞り、装置だけでなくライブラリー調製・前処理・解析ソフトまで含めて選ぶのが要点です。外部委託で済むなら受託サービスも選択肢になります。
- 読み方(短/長リード)
- スループットと単価
- ターンアラウンド
- ラボ規模(卓上→生産)
- 前処理・解析まで一式
代表的な製品迷ったらここから
IIlluminaNextSeq 1000 / NextSeq 2000中〜高スループットの卓上機。ターゲットやRNA-seqを一台で回したい主力ラボの定番。中〜高スループットのベンチトップNGSシステム。ターゲットシーケンス、RNA-seq、メタゲノム解析などに使われる。公式情報 → OOxford Nanopore TechnologiesPromethION 2 Integrated小型で高出力のロングリード。構造変異・全長解析やマルチオミクスを自前で。高出力ナノポアシーケンスを小型装置で実行するシステム。ロングリード解析やマルチオミクス用途で使われる。公式情報 → PPacBioRevio SystemHiFiの高精度ロングリードを大規模に。全ゲノム・構造変異・複雑領域の精密解析に。HiFiリードによる高精度ロングリードシーケンスを大規模に実行するシステム。全ゲノム、構造変異、複雑領域解析に使われる。公式情報 → IIlluminaDRAGEN Bio-IT Platform大量データの二次解析を高速化。変異・ゲノム・RNA-seqの解析が詰まる時に。高速な二次解析に使われるバイオインフォマティクスプラットフォーム。変異解析、ゲノム解析、RNA-seqなどに使われる。公式情報 → ショートリードNGSシーケンサー(9)
ゲノム・変異・RNA-seqを正確かつ低コストで。卓上機から生産スケールまで処理量で選ぶ。
IIlluminaNovaSeq X Series生産スケール・超高スループット解析向けのNGSシステム。全ゲノム、深いシーケンス、外来性因子解析など大規模解析で使われる。公式情報 IIlluminaNextSeq 1000 / NextSeq 2000中〜高スループットのベンチトップNGSシステム。ターゲットシーケンス、RNA-seq、メタゲノム解析などに使われる。公式情報 IIlluminaMiSeq i100 Series小型ベンチトップNGSシステム。小規模ラボやターゲットパネル、迅速解析用途で使われる。公式情報 IIlluminaMiSeq Systemベンチトップ型NGSシステム。アンプリコンシーケンス、微生物解析、ターゲット解析などに使われる。公式情報 IIlluminaiSeq 100 System小型ベンチトップNGSシステム。少数サンプルのシーケンス、教育・研究用途、ターゲット解析で使われる。公式情報 TThermo Fisher Scientific / Ion TorrentIon Torrent Genexus Systemサンプル精製、定量、ライブラリー調製、シーケンス、解析、レポート作成を自動化するNGSプラットフォーム。短いターンアラウンドが必要な解析で使われる。公式情報 TThermo Fisher Scientific / Ion TorrentIon GeneStudio S5 System半導体シーケンス技術を用いたIon Torrent NGSシステム。ターゲットシーケンス、感染症、がん研究、微生物解析などに使われる。公式情報 MMGI TechDNBSEQ-G400DNBSEQ技術を用いたベンチトップ〜中規模向けNGSシステム。ゲノム、トランスクリプトーム、ターゲット解析で使われる。公式情報 MMGI TechDNBSEQ-T20x2 / DNBSEQシリーズ大規模シーケンス向けのDNBSEQプラットフォーム。大量データが必要なゲノム解析や大規模研究で使われる。公式情報 ロングリードNGSシーケンサー(7)
構造変異や複雑領域、全長を一本で読みたい時に。ポータブル機から生産機まで。
OOxford Nanopore TechnologiesMinION Mk1B / Mk1C小型・ポータブルなナノポアシーケンサー。リアルタイム長鎖リード解析、迅速確認、小規模解析で使われる。公式情報 OOxford Nanopore TechnologiesGridION複数フローセルを運用できるベンチトップ型ナノポアシーケンサー。長鎖リード解析や中規模解析で使われる。公式情報 OOxford Nanopore TechnologiesPromethION 2 Integrated高出力ナノポアシーケンスを小型装置で実行するシステム。ロングリード解析やマルチオミクス用途で使われる。公式情報 OOxford Nanopore TechnologiesPromethION 24最大24個の高出力PromethIONフローセルを同時運用できる生産スケールのナノポアシーケンサー。公式情報 PPacBioRevio SystemHiFiリードによる高精度ロングリードシーケンスを大規模に実行するシステム。全ゲノム、構造変異、複雑領域解析に使われる。公式情報 PPacBioVega Systemベンチトップ型のロングリードシーケンサー。小規模ラボでのHiFiシーケンス利用を想定したシステム。公式情報 PPacBioSequel IIe SystemHiFiロングリードシーケンスに使われるシステム。全ゲノム、アンプリコン、複雑配列解析で使われる。公式情報 ライブラリー調製・前処理(10)
シーケンス前にDNA/RNAを読める形に。プラットフォームとターゲット濃縮の有無で選ぶ。
IIlluminaDNA Prep / RNA Prep / Library Prep KitsIlluminaシーケンサー向けのライブラリー調製キット。全ゲノム、ターゲット、RNA-seqなどに使われる。公式情報 IIlluminaNovaSeq X Series Reagent KitsNovaSeq Xシリーズ用の試薬カートリッジ、バッファ、フローセルなどを含むシーケンス試薬。公式情報 TThermo Fisher Scientific / Ion TorrentIon AmpliSeq Library KitsIon Torrentシステム向けのターゲットシーケンス用ライブラリー調製キット。公式情報 OOxford Nanopore TechnologiesLigation Sequencing Kit / Rapid Sequencing Kitナノポアシーケンス用のライブラリー調製キット。ロングリードDNA/RNA解析に使われる。公式情報 PPacBioSMRTbell Prep Kit / HiFi Prep KitsPacBio HiFiシーケンス向けのライブラリー調製キット。長鎖DNAの高精度解析に使われる。公式情報 TTwist BioscienceTarget Enrichment / NGS Panelsターゲット濃縮、ハイブリダイゼーションキャプチャ、カスタムパネルに使われるNGS関連製品。公式情報 IIDTxGen NGS Productsアダプター、プライマー、ターゲットキャプチャ、カスタムパネルなどのNGS関連製品。公式情報 NNEBNEBNext Library Prep KitsIlluminaやその他NGSプラットフォーム向けのライブラリー調製キット。公式情報 KKAPA / RocheKAPA HyperPrep KitsNGSライブラリー調製、増幅、定量に使われるキット。公式情報 AAgilentSureSelect Target Enrichmentターゲット濃縮、エクソーム、カスタムパネルに使われるNGSライブラリー調製ソリューション。公式情報 核酸抽出・品質確認(8)
サンプルから核酸を取り、ライブラリーの量と品質を確認する。前処理の土台。
TThermo Fisher ScientificKingFisher Flex磁気ビーズベースの自動核酸抽出装置。NGS、PCR、ウイルス検出、細胞株解析の前処理に使われる。公式情報 QQIAGENQIAcube Connectカラムベースの核酸抽出を自動化する装置。NGS、PCR、Sanger前処理に使われる。公式情報 PPromegaMaxwell Systems磁気ビーズベースの自動核酸抽出装置。細胞、血液、培養サンプルなどからDNA/RNAを抽出する。公式情報 AAgilentTapeStation SystemsDNA/RNA、NGSライブラリーのサイズ分布・品質確認に使われる。公式情報 AAgilentBioanalyzer SystemsDNA/RNA品質、ライブラリー品質確認に使われるマイクロ流体電気泳動装置。公式情報 AAgilentFragment AnalyzerDNA/RNA、NGSライブラリー、フラグメント解析に使われる装置。公式情報 TThermo Fisher Scientific / InvitrogenQubit FluorometerDNA/RNA/タンパク質などの蛍光定量に使われる小型装置。NGSライブラリー定量で使われる。公式情報 PPromegaQuantiFluor / Maxwell関連製品核酸定量や前処理に使われる製品群。公式情報 NGS自動化・ライブラリー調製装置(8)
調製や分注を自動化し、再現性とスループットを上げたい時に。多検体・標準化向け。
BBeckman Coulter Life SciencesBiomek NGeniuS SystemNGSライブラリー調製を自動化するシステム。ライブラリー調製、試薬管理、ワークフロー標準化に使われる。公式情報 BBeckman Coulter Life SciencesBiomek i-SeriesNGS前処理、PCRセットアップ、核酸抽出ワークフローの自動化に使われる。公式情報 HHamiltonMicrolab STARNGSライブラリー調製、核酸抽出、PCRセットアップに使われる自動分注システム。公式情報 TTecanFluent / Freedom EVO NGS WorkstationsNGSライブラリー調製、核酸抽出、プレート分注の自動化に使われる。公式情報 EEppendorfepMotionNGS前処理、PCRセットアップ、核酸抽出に使われる自動分注装置。公式情報 PPerkinElmer / RevvitySciclone / JANUS G3NGSライブラリー調製、核酸抽出、分注ワークフローに使われる自動化システム。公式情報 SSPT Labtechfirefly / mosquito / dragonfly discoveryNGSライブラリー調製、微量分注、PCRセットアップ、ミニチュア化に使われる。公式情報 MMGI TechMGISPシリーズNGSライブラリー調製やサンプル前処理を自動化するMGIのサンプル調製システム。公式情報 バイオインフォマティクス・解析ソフト(10)
出力データを変異・ゲノム・RNA-seqとして読み解く。クラウド管理や高速二次解析も。
IIlluminaBaseSpace Sequence HubIlluminaシーケンスデータの管理・解析に使われるクラウド型プラットフォーム。公式情報 IIlluminaDRAGEN Bio-IT Platform高速な二次解析に使われるバイオインフォマティクスプラットフォーム。変異解析、ゲノム解析、RNA-seqなどに使われる。公式情報 TThermo Fisher ScientificIon Reporter SoftwareIon Torrentデータの解析に使われるソフトウェア。ターゲットシーケンス、変異解析、レポート作成に使われる。公式情報 OOxford Nanopore TechnologiesEPI2MEナノポアシーケンスデータの解析ワークフローを提供するプラットフォーム。メタゲノム、ウイルス、ヒトゲノムなどの解析に使われる。公式情報 PPacBioSMRT LinkPacBioシーケンスデータの解析、HiFi reads生成、アセンブリ、変異解析に使われるソフトウェア。公式情報 QQIAGENCLC Genomics WorkbenchNGSデータ解析、RNA-seq、変異解析、微生物解析などに使われるソフトウェア。公式情報 QQIAGENIngenuity Pathway Analysis / OmicSoftオミクスデータ解析、パスウェイ解析、トランスクリプトーム解析に使われる。公式情報 DDNAnexusDNAnexus Platformクラウド型ゲノムデータ解析・管理プラットフォーム。大規模NGSデータの解析や共同研究に使われる。公式情報 SSeven BridgesSeven Bridges Platformクラウド型バイオインフォマティクス解析プラットフォーム。NGSデータ解析、パイプライン管理に使われる。公式情報 PPathoQuestNGS-based Biosafety AssaysNGSを用いた外来性ウイルス検出、バイオ医薬品・ワクチン・細胞治療関連の品質試験サービス。公式情報 受託解析サービス(11)
装置を持たず外注したい、あるいはGMP下の外来性因子検出が要る時に。
EEurofins GenomicsNGS Servicesターゲットシーケンス、アンプリコン、全ゲノム、RNA-seqなどに対応する受託NGSサービス。公式情報 AAzenta Life Sciences / GENEWIZNGS ServicesAmplicon-EZ、全ゲノム、RNA-seq、ターゲット解析などに対応する受託解析サービス。公式情報 MMacrogenNGS Services全ゲノム、エクソーム、RNA-seq、メタゲノムなどの受託NGS解析に対応。公式情報 FFasmacNGS受託解析国内向けのNGS受託解析サービス。アンプリコン、メタゲノム、RNA-seqなどに対応。公式情報 TTakara Bio受託解析サービスNGS、遺伝子解析、シーケンス関連の国内受託解析サービス。公式情報 CCharles River LaboratoriesNGS Testing for Adventitious Agent DetectionGMP条件下で外来性ウイルス検出や細胞株特性解析に使われるNGSサービス。公式情報 VViruSureNGS Testing for Adventitious Agent DetectionGMP対応のNGS外来性因子検出サービス。既知・未知のウイルス、細菌、マイコプラズマなどの検出に使われる。公式情報 AAvance BiosciencesNGS Adventitious Agents Testing既知・未知病原体の検出に使われるNGSベースの外来性因子試験サービス。公式情報 MMinaris Advanced TherapiesAgentSCREEN Adventitious Virus Detection by NGS細胞バンクや細胞由来サンプル向けのNGS外来性ウイルス検出サービス。公式情報 NNovogeneNGS Services全ゲノム、RNA-seq、メタゲノム、ターゲット解析などの受託NGSサービス。公式情報 BBGI GenomicsNGS Services大規模ゲノム解析、RNA-seq、メタゲノムなどの受託解析サービス。公式情報 データ管理・LIMS連携(6)
サンプル・結果・品質データを管理し、装置やLIMS/ELNとつなぐ基盤。
TThermo Fisher ScientificSampleManager LIMSNGSサンプル、試験依頼、結果、品質データを管理するLIMS。公式情報 LLabVantage SolutionsLabVantage LIMSQC試験、サンプル、結果、規格判定、承認フローを管理するLIMS。NGS結果管理にも関係する。公式情報 LLabWareLabWare LIMS製薬・バイオ医薬品QCの試験データ管理に使われるLIMS。公式情報 BBenchlingBenchling PlatformR&D向けのサンプル管理、実験記録、解析結果管理に使われるクラウドプラットフォーム。公式情報 TTetraScienceScientific Data Cloudラボ装置データ、NGSデータ、解析データを統合・標準化するクラウドデータ基盤。公式情報 SScitaraScitara DLXラボ機器、LIMS、ELN、解析アプリケーションを接続するデータ連携プラットフォーム。公式情報