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Sangerシーケンス のメーカー・製品一覧
関連解析装置・技術
キャピラリー電気泳動により、目的領域の塩基配列を一塩基単位で確認するSangerシーケンスです。プラスミドや細胞株の配列確認、変異の有無確認といった検証用途で用います。低〜中スループットを担う装置が中心で、キャピラリー本数による処理能力やフラグメント解析対応が選定軸です。
選び方
まず自社で読むか受託に出すかを決めます。自社なら、装置のキャピラリー数(同時に読める本数)でスループットを、試薬はテンプレート(PCR産物・プラスミド等)と読み取り長で選びます。GMP対応や難読配列(GCリッチ・反復)への強さも要確認です。
- 自社解析/受託
- キャピラリー数・処理量
- テンプレートの種類
- 読み取り長・配列品質
- GMP・データ管理対応
代表的な製品迷ったらここから
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsSeqStudio Genetic Analyzer低〜中スループットの自社配列確認に。ベンチトップで導入しやすいSangerシーケンスとフラグメント解析に対応するベンチトップ型キャピラリー電気泳動装置。低〜中スループットの配列確認に使われる。公式情報 →
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsBigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing KitプラスミドからBACまで対応する定番のサイクルシーケンス試薬Sangerシーケンス用の代表的なサイクルシーケンスキット。PCR産物、プラスミド、fosmid、BACテンプレートなどの配列確認に使われる。公式情報 →
Eurofins GenomicsDNAシーケンスサービス装置を持たず外注したいとき。国内向けで納期が速い国内向けのSanger DNAシーケンス受託サービス。解析結果は最短でサンプル到着日に報告されるサービスとして案内されている。公式情報 →
PromegaSpectrum Compact CE System少数サンプルをベンチトップで自社運用したいときの選択肢Sangerシーケンスとフラグメント解析に対応するベンチトップ型キャピラリー電気泳動装置。公式情報 →
Sangerシーケンス装置・キャピラリー電気泳動装置(7)
自社でSanger反応産物を読むとき。処理量(キャピラリー数)で選ぶ
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsSeqStudio Genetic AnalyzerSangerシーケンスとフラグメント解析に対応するベンチトップ型キャピラリー電気泳動装置。低〜中スループットの配列確認に使われる。公式情報
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsSeqStudio Flex Genetic AnalyzerSangerシーケンスとフラグメント解析に対応するSeqStudioシリーズの拡張モデル。複数キャピラリー構成でスループットに応じて選択できる。公式情報
Thermo Fisher Scientific / Applied Biosystems3500 Genetic Analyzer8キャピラリー構成の遺伝子解析装置。Sangerシーケンス、フラグメント解析、STR解析に使われる。公式情報
Thermo Fisher Scientific / Applied Biosystems3500xL Genetic Analyzer24キャピラリー構成の遺伝子解析装置。Sangerシーケンスやフラグメント解析の高スループット運用に使われる。公式情報
Thermo Fisher Scientific / Applied Biosystems3730xl DNA Analyzer高スループットのキャピラリー電気泳動装置。大量のSangerシーケンスやフラグメント解析に使われる。公式情報
Sangerシーケンス試薬(8)
サイクルシーケンス反応とその前処理。テンプレートと読み取り長で選ぶ
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsBigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing KitSangerシーケンス用の代表的なサイクルシーケンスキット。PCR産物、プラスミド、fosmid、BACテンプレートなどの配列確認に使われる。公式情報
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsBigDye Terminator v1.1 Cycle Sequencing Kit短いPCR産物や特定用途のSangerシーケンス反応に使われるサイクルシーケンスキット。公式情報
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsBigDye Direct Cycle Sequencing KitPCRとシーケンスを簡略化するためのSangerシーケンス関連キット。PCR産物の直接シーケンスに使われる。公式情報
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsBigDye XTerminator Purification KitBigDye反応後の精製に使われるキット。キャピラリー電気泳動前の反応クリーンアップに使われる。公式情報
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsExoSAP-IT PCR Product Cleanup ReagentPCR産物中のプライマーやdNTPを分解し、Sangerシーケンス前処理に使われるクリーンアップ試薬。公式情報
サーマルサイクラー・PCR前処理(7)
前処理PCRやサイクルシーケンス反応の温度制御に
PCR産物・シーケンス反応精製(7)
残存プライマー・dNTP除去や反応後クリーンアップに
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsBigDye XTerminator Purification KitBigDye反応後のクリーンアップに使われるキット。キャピラリー電気泳動前処理に使われる。公式情報
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsExoSAP-IT PCR Product Cleanup ReagentPCR産物中の残存プライマーやdNTPを処理するクリーンアップ試薬。Sanger前処理に使われる。公式情報
Cytivaillustra ExoProStar / GFX PCR DNA and Gel Band Purification KitPCR産物やDNA断片の精製に使われる製品群。Sanger前処理で使われる。公式情報
解析ソフト・データ管理(8)
クロマトグラム確認・配列比較・変異確認・記録管理に
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsSequencing Analysis SoftwareSangerシーケンスデータのベースコールやクロマトグラム確認に使われるソフトウェア。公式情報
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsSeqScape SoftwareSangerシーケンスデータのアライメント、変異確認、配列比較に使われるソフトウェア。公式情報
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsVariant Reporter SoftwareSangerシーケンスデータの変異確認やレポート作成に使われるソフトウェア。公式情報
受託解析サービス(10)
装置を持たず外注、または少数サンプルを早く確認したいとき