細胞株開発・クローン選抜
候補クローンの染色体構成が正常かを確認し、異常クローンを除外する。
- 染色体構成確認
- 異常クローン除外
核型解析は、細胞製品の染色体構造・本数やゲノムの健全性を評価する品質試験です。Gバンド分染による古典的核型解析に加え、SNP/CGHアレイによるデジタル核型でコピー数変化や欠失・増幅を高分解能に検出します。セルバンク作製やiPS細胞・細胞治療の製造で、長期培養に伴う染色体異常の有無を確認するために受託・装置の両形態で使われます。
核型解析には、分裂中期の染色体をGバンド分染して顕微鏡下で観察する古典的核型解析と、SNPアレイ・CGHアレイでコピー数やヘテロ接合性消失(LOH)を網羅的に解析するデジタル核型があります。Gバンドは数的・大きな構造異常や転座、モザイクの把握に向き、アレイは数百kb〜数Mb規模の微小な増幅・欠失を高分解能で検出できます。
選定軸は、検出したい異常のスケール(数的異常・大規模転座か、微小なコピー数変化か)、バランス型転座の検出可否、モザイク率の評価要件、必要な分解能、培養可能な分裂細胞が得られるか、ターンアラウンドとGMP対応の要否です。バランス型転座はアレイでは原理上検出できず、逆に微小欠失はGバンドの分解能を超えるため、両者は相補的に使われます。
工程設計では、評価のタイミング(MCB/WCB作製時、製造上限継代、製造終了時細胞)と継代数の取り方を規格に組み込みます。iPS・幹細胞では一定継代ごとの核型モニタリングが一般的で、解析設計、参照ゲノム、判定基準、記録とトレーサビリティを事前に定義しておくことが重要です。
Gバンド核型では分裂中期の染色体標本を作製して分染・観察し、デジタル核型では抽出DNAをアレイにかけてコピー数を解析します。
核型解析は、細胞株の樹立から製造終了まで、染色体・ゲノムの健全性確認に使われます。
候補クローンの染色体構成が正常かを確認し、異常クローンを除外する。
MCB・WCB作製時の核型を取得し、規格・申請資料の一部とする。
製造上限継代や製造終了時細胞の核型を確認し、安定性を評価する。
リプログラミングや長期培養に伴う染色体異常を定期的に監視する。
判定基準、記録、ロット管理、トレーサビリティの一部として運用する。
核型解析は、細胞を出発原料・製造基材とするモダリティーで特に重要になります。