GEN の8月号に、シングルセルの機能免疫解析（single-cell functional immunomics）がこの10年でどう進んだかを論じる記事が掲載された。Feromics 共同創業者でノースイースタン大学准教授の Tania Konry 氏によるものである。
持っているものではなく、していることを測る
シングルセルRNA-seqは1細胞ごとに転写産物を読み、細胞の種類や状態を分類する手法だが、返すのはその瞬間にどんな分子を持っていたかである。細胞を壊して読むため、1細胞につき1点しか得られない。
免疫細胞で知りたいのは、標的の細胞に接触したか、接触して殺せたか、どれだけのサイトカインを出したか、何個の標的を続けて殺せるか（serial killing）、疲弊せずにどれだけ持続するかである。いずれも時間の中で起きる振る舞いで、一時点のスナップショットからは読み取れない。
細胞を個別に隔離して時間を追う手法
生きたまま1細胞ずつ時間を追って観察するには、細胞を1個ずつ隔離する必要がある。用いられてきたのは主に、微細なくぼみを多数並べて1細胞ずつ落とし込み顕微鏡で連続観察するマイクロウェルと、油中に水滴を作って細胞と標的を封じ込め数を稼ぐ液滴（ドロップレット）である。いずれもエフェクター細胞と標的細胞を同じ区画に入れて殺傷の様子や分泌物を追う設計で、分泌タンパク質はビーズや基板に捕捉して蛍光で読む。記事は、生細胞イメージングとハイコンテント解析の技術がこの10年で扱える細胞数と観察時間を押し上げてきたとしている。
実務の確認ポイント細胞治療の力価試験に用いる際の留意点
CAR-Tのような細胞治療では出荷判定に力価試験が要るが、集団平均で測る従来の細胞傷害性アッセイには限界がある。平均は分布を隠し、全体の10%が強く働いているのか全体が均等に弱く働いているのかを区別できず、ロット間差の原因も平均値だけでは追えない。1細胞ごとの機能分布が見えれば、製品を平均値ではなく分布で記述でき、細胞治療の同等性評価や工程変更の影響評価でも判断材料が増える。
研究の道具を出荷判定の試験にするには、装置と操作者が変わっても同じ結果が出るかという頑健性、分布のどこを見て合否を決めるのか（中央値か、上位画分の割合か）という判定基準、分析法の特異性として何を測っているかの説明が要る。所要時間も効く。自家細胞治療では製造から投与までの時間が限られ、保存期間も短いため、数日かかる試験は出荷判定に使いにくい。
※ 本ページは公開情報（GEN の記事）をもとにしたProglenth編集部による整理です。論考の詳細・引用文献・具体的な手法は一次情報をご確認ください。