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プラスミドのスーパーコイル含量（%SC）とは？
スーパーコイル含量（%SC）は、プラスミドDNAのうち閉環状スーパーコイル（ccc）型が占める割合で、原材料プラスミドの品質指標です。線状・開環（ニック）型より導入効率が高いとされ、AAV・mRNA等の原材料品質として管理されます。
スーパーコイル含量を見る理由
スーパーコイル型は導入効率が高いとされる
製造・保存でトポロジーが変化する
AAV/mRNA原材料の品質に直結する
手法の比較 ― どの方法で測るか
| 手法 | 原理 | 何が分かる | 使い分け |
|---|---|---|---|
| AEX-HPLC | 陰イオン交換でトポロジー別に分離 | スーパーコイル/開環/線状の% | %SC定量の主力 |
| キャピラリーゲル電気泳動（CGE） | 電気泳動でトポロジー分離 | %SC | 高分解能の定量 |
| アガロースゲル電気泳動 | 泳動・染色で目視/濃度測定 | %SCの概観 | 簡易確認 |
こんな場面で使う
- 原材料プラスミドの%SC確認
- 発酵・精製・保存でのトポロジー安定性
- ロット規格・同等性評価
主な測定項目
- スーパーコイル含量（%SC）
- 開環（ニック）・線状の割合
- 純度・均一性
関連分析とのつながり
スーパーコイル含量を評価するときのポイント
AEX-HPLCとCGEを直交的に用いる
せん断・凍結融解でニック化が進む点に注意
標準（線状/開環）でピーク帰属を確認する
保存・温度でのトポロジー安定性を評価する
規格としての%SC下限を設定する
AAV/mRNA原材料としての要求水準を踏まえる
