用語集
「ニック」とは？
DNA鎖に入った切れ目で、多いと不完全な転写産物を生みやすい。
DNA鎖に入った切れ目で、多いと不完全な転写産物を生みやすい。
ニックとは、DNA二本鎖の片方の鎖に生じる切れ目のことです。ニックが入ったプラスミドはスーパーコイル体からオープンサーキュラー体（OC体）へと変化し、不純物として扱われるため、トランスフェクション効率やIVT鋳型としての性能に直接影響してきます。
プラスミドDNAは、らせんが巻き締まったスーパーコイル体（共有結合閉環状体）として存在するのが理想的な状態です。片方の鎖にニックが入ると、この巻き締まりが解けて弛緩したオープンサーキュラー体（OC体）になります。OC体は直鎖体・変性体・多量体とともに不純物として扱われ、スーパーコイル体と比べてトランスフェクション効率やIVT鋳型としての性能が低下します。製造・精製の工程でいかにスーパーコイル体の比率を保てるかが、品質管理上の重要な指標となります。
ニックは保存中の物理的ストレスだけでなく、精製の過程でも生じます。大腸菌が持つエンドヌクレアーゼ（endA）が活きた状態だと、精製中にプラスミドへニックが入り、スーパーコイル体がOC体へと変わってしまいます。これを防ぐために、endA欠損株を用いることで背景ニックを抑え、スーパーコイル体の比率と収量を保ちやすくなります。また、recA欠損は反復・パリンドローム配列の組換えによる欠失や多量体化を抑える役割を担い、両方の欠損を組み合わせるのが実務上の定番的なアプローチです。
この定義はProglenth編集部が一般的・基礎的な内容として整理したものです。実際の管理基準・要件は製品・企業・各極の規制により異なります。 正確な運用は各極の薬局方・ガイドライン（ICH／GMP等）やメーカーの一次情報をご確認ください。