「DNase処理」とは?
残った鋳型DNAを分解酵素DNaseで除く工程。IVT後のmRNAから不要なDNAを取り除くために行います。
残った鋳型DNAを分解酵素DNaseで除く工程。IVT後のmRNAから不要なDNAを取り除くために行います。
DNase処理とは、IVT(試験管内転写)後のmRNA合成液に残った鋳型DNAを、分解酵素DNaseで除く工程です。反応液には目的のmRNA以外にも鋳型DNA断片が混在するため、この処理が下流の精製工程や品質管理の前提となります。
DNase処理はIVT反応の直後に行い、転写に使った鋳型DNAを分解して取り除くことを目的とします。IVT反応液には目的のmRNAだけでなく、dsRNA、途中で切れた短鎖RNA、反応に使った酵素やヌクレオチド、そして分解しきれなかった鋳型DNA断片が混在しています。DNase処理はこれらのうち鋳型DNAを除く最初のステップとして位置づけられ、その後にオリゴdTアフィニティー精製など複数の手法を組み合わせて純度をさらに高めていきます。残存DNAはmRNA原薬の品質指標として管理される対象であり、DNase処理単独でなく下流精製と組み合わせて規格を満たす水準まで作り込むのが実務上の考え方です。
mRNA合成の文脈だけでなく、AAVなどウイルスベクターのゲノム力価測定においてもDNase処理は重要な前処理として登場します。カプシドに封入されていない遊離の核酸をDNase処理で除いたうえで、カプシドを分解して内包ゲノムを定量することで、「封入ゲノムだけを数える」という測定の目的が達成されます。この処理が不十分だと遊離DNAも定量値に混入するため、DNase処理とカプシド分解の前処理の組み合わせが、ゲノム力価という指標の妥当性を直接左右します。
DNase処理の効果を最大化するには、IVTに先立つ段階からの管理も重要です。プラスミドの線状化と鋳型調製の段階から残存DNAを抑える設計をしたうえで、DNase処理と下流工程での制御を組み合わせるのが実務の基本とされています。また、DNase処理を経てもなお分解しきれなかった鋳型DNA断片が残ることがあるため、残存DNAはあくまで「DNase処理と下流精製で管理する」ものとして捉え、単一工程で完結する話ではないという認識が求められます。
この定義はProglenth編集部が一般的・基礎的な内容として整理したものです。実際の管理基準・要件は製品・企業・各極の規制により異なります。 正確な運用は各極の薬局方・ガイドライン(ICH/GMP等)やメーカーの一次情報をご確認ください。