知っておきたいこと
大阪大学発の免疫データ解析の会社
KOTAIバイオテクノロジーズは2016年5月、大阪大学免疫学フロンティア研究センターでの研究成果をもとに設立されました。2018年に実験室を立ち上げ、実験から情報解析までを自社で行う体制を整えています。2023年7月に三洋貿易の子会社となり、2024年7月に本店を大阪府箕面市に移しました。2026年7月時点の従業員は23名です。
受託解析は2019年、10x Genomicsの認定サービスプロバイダーとしてシングルセル解析から始めました。2025年には同社のPreferred Service Providerに選ばれています。2024年4月からは、信頼性基準に沿った受託解析を始め、医薬品の承認申請に使うデータを集められるようにしました。最初の対象はXenium In Situです。
Olinkで測る血清・血漿のタンパク質
プロテオーム解析では、2つの抗体とDNAタグを使うOlinkのProximity Extension Assay（PEA）を4つの形で受けます。
| 形 | 測定タンパク質数 | 検出 | 1サンプルの量 |
|---|---|---|---|
| Target 48 | 42〜45 | qPCR | 25µL |
| Target 96 | 92 | qPCR | 25µL |
| Reveal | 1,000以上 | NGS | 50µL |
| Explore HT | 5,400以上 | NGS | 50µL |
Target 48にはヒトのCytokine、Immune Surveillance、Neurodegenerationと、マウスのCytokineのパネルがあり、サイトカインをpg/mLで絶対定量できます。Target 96はInflammation、Cardiometabolic、Immuno-Oncologyなど11パネルです。サンプルは血清・血漿で、Revealは10サンプルからの相乗りにも対応します。
シングルセルと空間の解析
シングルセル解析では、遺伝子発現（Flex v2、RNA-seq）と、T細胞・B細胞の受容体を細胞ごとに読む免疫プロファイリングを受けます。TCRのα鎖・β鎖、BCRのH鎖・L鎖を対で解析でき、5'RNA-seqも併せて行えます。
空間解析では、Xenium In SituでFFPEや新鮮凍結の切片の遺伝子発現を、最大5,000遺伝子のパネルで調べます。MACSimaは600種以上の検証済み抗体を使う多重免疫蛍光で、Xeniumを行ったのと同じスライドでタンパク質も解析できます。
同じ組織切片で、遺伝子とタンパク質の発現を空間的に重ねて見られます。
データ解析と相談先
シングルセルRNA-seq、空間トランスクリプトーム、バルクRNA-seqのデータ解析も受けます。大学や製薬企業との共同研究では、創薬標的やバイオマーカーの同定にも取り組んでいます。受託の相談は、受託サービスのお問い合わせフォームで受けています。