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デジタルPCR装置 のメーカー・製品一覧

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絶対定量AAV力価ベクターコピー数低頻度変異
12社 ・ 22製品

反応液を微小区画に分割し、エンドポイントから核酸を絶対定量するデジタルPCR装置です。AAV力価やベクターコピー数の定量、低頻度変異の検出といった高感度・高精度を要する用途で使われます。ドロップレット方式かナノプレート方式かで運用性が異なり、必要なマルチプレックス数とあわせた検討が要点です。

選び方

デジタルPCR(サンプルを数万区画に分け、1分子単位で数える絶対定量。標準曲線が要らず、希少な変異やコピー数も拾いやすい)は、まず区画化の方式(液滴/ナノプレート/マイクロ流体)と一度に測れる色数(多重度)で性格が分かれます。次にAAVなどウイルスベクターの力価測定に使うか、医薬品の品質試験(残存DNA等)に使うかで、必要な試薬・前処理・解析ソフトやLIMS連携まで含めて絞り込みます。自社で持つか、受託試験に出すかも分岐点です。

代表的な製品迷ったらここから

Bio-RadQX600 / QX600 AutoDG / QX ONE Droplet Digital PCR液滴方式の定番。6色多重・コピー数・低頻度変異・絶対定量を幅広くこなしたいとき。Droplet Digital PCRシステム。6色マルチプレックス解析、コピー数解析、低頻度変異、絶対定量に使われる。公式情報 →
QIAGENQIAcuity Digital PCR Systemナノプレート型で区画化〜イメージングを統合。AAV力価・CNV・変異検出をまとめて回したいとき。ナノプレート型のデジタルPCR。パーティショニング・サーマルサイクル・イメージングを統合し、CNV、変異検出、遺伝子編集解析に使われる。公式情報 →
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsQuantStudio Absolute Q Digital PCR Systemマイクロ流体アレイで1台にワークフロー統合。絶対定量・希少変異検出をシンプルに運用したいとき。マイクロ流体アレイプレート技術を用い、1台にワークフローを統合したデジタルPCR。絶対定量・希少変異検出に使われる。公式情報 →
Eurofins BioPharma Product TestingdPCR / qPCR / Residual DNA Testing装置を持たず外注したいとき。残存DNAなどバイオ医薬品の品質試験を受託で。バイオ医薬品品質試験、残存DNA、分子生物学的試験に対応する受託試験サービス。公式情報 →

デジタルPCR装置4

1分子で絶対定量する本体。区画化方式と多重度(色数)で選ぶ。

Bio-RadQX600 / QX600 AutoDG / QX ONE Droplet Digital PCRDroplet Digital PCRシステム。6色マルチプレックス解析、コピー数解析、低頻度変異、絶対定量に使われる。公式情報
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsQuantStudio Absolute Q Digital PCR Systemマイクロ流体アレイプレート技術を用い、1台にワークフローを統合したデジタルPCR。絶対定量・希少変異検出に使われる。公式情報
QIAGENQIAcuity Digital PCR Systemナノプレート型のデジタルPCR。パーティショニング・サーマルサイクル・イメージングを統合し、CNV、変異検出、遺伝子編集解析に使われる。公式情報
Stilla Technologiesnaica systemCrystal Digital PCR技術を用いたデジタルPCR。マルチプレックス解析、希少変異検出、細胞治療関連解析で使われる。公式情報

デジタルPCR試薬・マスターミックス4

装置に合わせて選ぶ消耗品。プローブ法かEvaGreen法か、多重対応かが分かれ目。

Bio-RadddPCR Supermix for Probes / EvaGreen / Multiplexプローブ法・EvaGreen法・マルチプレックスddPCRに使われるマスターミックス。コピー数解析、変異検出、絶対定量に使われる。公式情報
Thermo Fisher Scientific / Applied BiosystemsAbsolute Q DNA / RNA Digital PCR Master MixQuantStudio Absolute Qで使われるデジタルPCR用マスターミックス。DNA/RNAターゲットの絶対定量に使われる。公式情報
QIAGENQIAcuity Probe / EG PCR KitQIAcuity用のプローブ/EvaGreenベースdPCRキット。変異検出、コピー数、遺伝子発現解析に使われる。公式情報
Stilla Technologiesnaica PCR Mixes / Crystal Digital PCR Reagentsnaica system向けのdPCR試薬。マルチプレックス解析や核酸定量に使われる。公式情報

AAV・ウイルスベクター定量キット4

AAVなどのゲノム力価測定に。遺伝子治療の品質評価で使うとき。

Bio-RadAAV Titration by ddPCR ApplicationsddPCRを用いたAAVベクターゲノム力価測定に関係するアプリケーション。AAV品質評価で使われる。公式情報
QIAGENQIAcuity AAV Titer ApplicationsQIAcuityを用いたAAVゲノム定量、コピー数解析、ウイルスベクター関連解析に使われる。公式情報
Takara BioAAVpro Titration Kit関連製品AAVベクターの力価測定や関連解析に使われる試薬群。公式情報
ProgenAAV Titration / Reference MaterialsAAVカプシド力価測定や参照用途の製品。dPCRによるゲノム力価測定と組み合わせて評価される。公式情報

核酸抽出・前処理装置3

残存DNAやウイルス核酸を測る前のサンプル調製を自動化したいとき。

Thermo Fisher ScientificKingFisher Flex磁気ビーズベースの核酸抽出装置。残存DNA、AAV、ウイルス核酸などの前処理に使われる。公式情報
QIAGENQIAcube Connect / QIAsymphony核酸抽出を自動化する装置。PCR、dPCR、NGS前処理に使われる。公式情報
PromegaMaxwell Systems磁気ビーズベースの自動核酸抽出装置。細胞・培養サンプルからDNA/RNAを抽出する。公式情報

データ解析・LIMS連携3

コピー数・変異の解析と、品質試験の結果・サンプル情報の管理をつなぎたいとき。

Bio-RadQX Manager SoftwareBio-Rad ddPCRシステムのデータ取得・解析ソフトウェア。コピー数、変異検出、マルチプレックス解析に使われる。公式情報
QIAGENQIAcuity Software SuiteQIAcuityデジタルPCRの解析ソフトウェア。コピー数、変異検出、CNV、遺伝子発現解析に使われる。公式情報
Thermo Fisher ScientificAbsolute Q Software / SampleManager LIMSAbsolute Qの解析ソフトと、dPCR結果・品質試験・サンプル情報を管理するLIMS。公式情報

受託試験・解析サービス4

装置を持たず、品質試験やAAV力価測定を外部に任せたいとき。

Eurofins BioPharma Product TestingdPCR / qPCR / Residual DNA Testingバイオ医薬品品質試験、残存DNA、分子生物学的試験に対応する受託試験サービス。公式情報
Charles River LaboratoriesMolecular Biology / Viral Safety Testingバイオ医薬品・細胞治療向けの分子生物学的試験、ウイルス安全性試験に対応する。公式情報
GenScript ProBioAAV / Cell & Gene Therapy Analytical ServicesAAVや細胞・遺伝子治療関連の分析、力価、品質試験に関係する受託サービス。公式情報
VectorBuilderAAV / Lentivirus Titer Testing ServicesAAV、レンチウイルスベクターの力価測定や品質評価に関係するサービス。公式情報

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