Makers & Productsメーカー・製品一覧
ライブラリー調製・前処理 のメーカー・製品一覧
関連解析装置・技術
NGS前処理アダプター付加ターゲット濃縮ライブラリーQC
37社 ・ 56製品
NGS解析に向け、核酸へのアダプター付加やターゲット濃縮を行う前処理工程と試薬群です。細胞株の安全性試験や遺伝的安定性評価などの関連解析を支え、シーケンス品質はここで決まります。入力量や対象(DNA/RNA)への適合と、ライブラリーQCまで含めたワークフローの一貫性が選定の鍵です。
選び方
まず使うシーケンサー(Illumina/Ion/ナノポア/PacBio/DNBSEQ)に対応するキットかを確認。次に試料の種類(DNA/RNA)と入力量、全ゲノムかターゲット解析かで絞り、処理本数が多ければ自動化装置とQCをセットで検討します。
- 対応シーケンサー
- DNA/RNA・入力量
- 全ゲノム/ターゲット
- 自動化対応
- 内製か受託か
代表的な製品
IIlluminaIllumina DNA PrepIllumina向け定番のDNA調製キット。多様なゲノム解析の起点にDNAライブラリー調製キット。多様なゲノム解析に使われ、Illuminaシーケンサー向けに最適化されている。公式情報 → IIlluminaIllumina Stranded mRNA Prep遺伝子発現・細胞状態を見るmRNA-seqの標準的な選択肢mRNA-seq用のライブラリー調製キット。遺伝子発現解析や細胞状態評価に使われる。公式情報 → BBeckman Coulter Life SciencesAMPure XPライブラリー精製・サイズ選択の事実上の標準磁気ビーズPCR産物やNGSライブラリーの精製・サイズ選択に使われる磁気ビーズ。公式情報 → TThermo Fisher Scientific / InvitrogenQubit Fluorometer投入前のDNA/RNA・ライブラリー蛍光定量に広く使われる小型機DNA/RNAやNGSライブラリーの蛍光定量に使われる小型装置。公式情報 → NGSライブラリー調製キット(14)
シーケンサーと試料(DNA/RNA・入力量)に合わせて選ぶ基本キット
メーカー製品特徴問い合わせ
IlluminaIllumina DNA PrepDNAライブラリー調製キット。多様なゲノム解析に使われ、Illuminaシーケンサー向けに最適化されている。公式サイト IlluminaNextera XT DNA Library Preparation Kit小ゲノム、PCRアンプリコン、プラスミド、cDNAなどのライブラリー調製に使われるキット。短時間ワークフローと低入力量が特徴。公式サイト IlluminaIllumina RNA PrepRNA-seq用ライブラリー調製キット。遺伝子発現やトランスクリプトーム解析に使われる。公式サイト IlluminaIllumina Stranded mRNA PrepmRNA-seq用のライブラリー調製キット。遺伝子発現解析や細胞状態評価に使われる。公式サイト Thermo Fisher Scientific / Ion TorrentIon AmpliSeq Library Kit 2.0Ion AmpliSeqパネルを用いたアンプリコンライブラリーを迅速に調製するキット。ターゲットシーケンスに使われる。公式サイト Thermo Fisher Scientific / Ion TorrentIon AmpliSeq HD Library KitIon AmpliSeq HD技術を用いたアンプリコンベースのライブラリー調製キット。低頻度変異や高感度解析で使われる。公式サイト Oxford Nanopore TechnologiesLigation Sequencing Kitナノポアシーケンス用のライゲーションベースライブラリー調製キット。ロングリードDNA解析に使われる。公式サイト Oxford Nanopore TechnologiesRapid Sequencing Kit短時間でナノポアライブラリーを作製するキット。迅速確認や現場解析で使われる。公式サイト PacBioSMRTbell Prep KitPacBio HiFiシーケンス向けのライブラリー調製キット。ロングリード高精度解析に使われる。公式サイト NEBNEBNext Library Prep KitsIlluminaなどのNGS向けライブラリー調製キット。DNA、RNA、低入力、ターゲット解析などに対応する。公式サイト KAPA / RocheKAPA HyperPrep KitsNGSライブラリー調製、増幅、定量に使われるキット。Illumina向けワークフローで広く使われる。公式サイト Takara BioSMART-Seq / ThruPLEX関連製品RNA-seq、低入力、シングルセル、DNAライブラリー調製などに使われるNGS関連製品。公式サイト QIAGENQIAseq Library KitsDNA/RNAターゲット解析、miRNA、RNA-seqなどに使われるNGSライブラリー調製キット。公式サイト MGI TechDNBSEQ Library Prep KitsDNBSEQプラットフォーム向けのライブラリー調製キット。ゲノム、RNA、ターゲット解析に使われる。公式サイト ターゲット濃縮・パネル(8)
全領域でなく目的の遺伝子・変異だけ深く読みたい時
メーカー製品特徴問い合わせ
Thermo Fisher Scientific / Ion TorrentIon AmpliSeq PanelsPCRベースのターゲットシーケンスパネル。遺伝子パネル、変異解析、アンプリコン解析に使われる。公式サイト Thermo Fisher Scientific / Ion TorrentIon AmpliSeq DesignerカスタムIon AmpliSeqパネルを設計できるオンラインツール。目的ターゲットに応じたパネル設計に使われる。公式サイト AgilentSureSelect Target Enrichmentハイブリッドキャプチャによるターゲット濃縮製品。エクソーム、カスタムパネル、疾患パネルなどに使われる。公式サイト Twist BioscienceTwist Target Enrichment / Custom Panelsハイブリッドキャプチャ型のターゲット濃縮パネル。カスタムパネルや感染症・がん関連パネルなどに使われる。公式サイト IDTxGen NGS Panels / Hybridization CaptureNGSターゲット濃縮用プローブ、パネル、アダプター、インデックス製品を展開。公式サイト Roche SequencingKAPA HyperCap / AVENIO関連製品ターゲット濃縮、キャプチャ、NGSライブラリー調製に使われる製品群。公式サイト IlluminaIllumina DNA Prep with EnrichmentDNAライブラリー調製とターゲット濃縮を組み合わせたワークフロー。エクソームやカスタムパネル解析に使われる。公式サイト QIAGENQIAseq Targeted DNA PanelsターゲットDNAシーケンス向けのパネル製品。変異解析やターゲット解析に使われる。公式サイト ライブラリー調製自動化装置(10)
処理本数が多く手作業のばらつき・工数を減らしたい時
メーカー製品特徴問い合わせ
Beckman Coulter Life SciencesBiomek i-SeriesNGSライブラリー調製、核酸抽出、PCRセットアップなどに使われる自動分注システム。公式サイト Beckman Coulter Life SciencesBiomek NGS Sample Prep MethodsNGSサンプル前処理を自動化するBiomek用メソッド群。実サンプルで高品質データ生成が確認されたメソッドとして案内されている。公式サイト HamiltonMicrolab STARNGSライブラリー調製、核酸抽出、PCRセットアップに使われるリキッドハンドリングシステム。公式サイト TecanFluent / Freedom EVO NGS WorkstationsNGSライブラリー調製、核酸抽出、プレート分注の自動化に使われる。公式サイト EppendorfepMotionNGS前処理、PCRセットアップ、核酸抽出に使われる自動分注装置。公式サイト RevvitySciclone / JANUS G3NGSライブラリー調製、核酸抽出、分注ワークフローに使われる自動化システム。公式サイト SPT Labtechfirefly / mosquito / dragonfly discoveryNGSライブラリー調製、微量分注、PCRセットアップ、ミニチュア化に使われる。公式サイト MGI TechMGISPシリーズDNBSEQ向けNGSライブラリー調製やサンプル前処理を自動化するシステム。公式サイト AgilentBravo NGS WorkstationNGSライブラリー調製、ターゲット濃縮、前処理自動化に使われるワークステーション。公式サイト OpentronsFlex / OT-2研究用自動分注プラットフォーム。NGSライブラリー調製やPCRセットアップの自動化で使われる。公式サイト 断片化・サイズ選択・精製(7)
調製前後の断片化・精製・サイズ選択を安定させたい時
メーカー製品特徴問い合わせ
CovarisME220 / M220 Focused-ultrasonicator音響せん断によるDNA断片化装置。NGSライブラリー調製で均一な断片化に使われる。公式サイト Diagenode / HologicBioruptor超音波破砕によるDNA断片化やクロマチン断片化に使われる装置。公式サイト Beckman Coulter Life SciencesAMPure XPPCR産物やNGSライブラリーの精製・サイズ選択に使われる磁気ビーズ。公式サイト Thermo Fisher ScientificDynabeads / MagMAX関連製品磁気ビーズベースの精製、核酸抽出、ライブラリー調製前後の前処理に使われる。公式サイト Beckman Coulter Life SciencesSPRIselect Reagent KitNGSライブラリーのサイズ選択・精製に使われる磁気ビーズ試薬。公式サイト Zymo ResearchDNA Clean & Concentrator KitsDNAクリーンアップ、濃縮、NGS前処理に使われるキット。公式サイト QIAGENQIAquick / MinElute KitsPCR産物、DNA断片、ライブラリー調製中間体の精製に使われるカラムキット。公式サイト ライブラリーQC・定量(7)
シーケンス投入前にライブラリーの量と品質を確認したい時
メーカー製品特徴問い合わせ
Thermo Fisher Scientific / InvitrogenQubit FluorometerDNA/RNAやNGSライブラリーの蛍光定量に使われる小型装置。公式サイト AgilentTapeStation SystemsDNA/RNA/NGSライブラリーのサイズ分布・品質確認に使われる自動電気泳動システム。公式サイト AgilentBioanalyzer Systemsマイクロ流体電気泳動によるDNA/RNA品質、NGSライブラリー品質確認に使われる。公式サイト AgilentFragment Analyzer Systems自動パラレルキャピラリー電気泳動によるDNA/RNA/NGSライブラリーQC装置。公式サイト Roche / KAPAKAPA Library Quantification KitsIlluminaライブラリーなどのqPCR定量に使われるキット。シーケンス投入量の調整に使われる。公式サイト PromegaQuantus Fluorometer蛍光ベースの核酸定量装置。NGSライブラリーや抽出核酸の定量に使われる。公式サイト DeNovixDS-11 / QFX Fluorometer微量吸光度測定、蛍光定量に使われる核酸定量装置。公式サイト 受託ライブラリー調製・NGS解析サービス(10)
内製せず外注したい/GMP・外来性因子検出が必要な時
メーカー製品特徴問い合わせ
Eurofins GenomicsNGS Servicesライブラリー調製、ターゲット解析、全ゲノム、RNA-seqなどに対応する受託NGSサービス。公式サイト Azenta Life Sciences / GENEWIZNGS Servicesライブラリー調製、Amplicon-EZ、全ゲノム、RNA-seq、ターゲット解析などに対応する受託解析サービス。公式サイト MacrogenNGS Services全ゲノム、エクソーム、RNA-seq、メタゲノムなどの受託NGS解析に対応。公式サイト FasmacNGS受託解析国内向けのNGS受託解析サービス。アンプリコン、メタゲノム、RNA-seqなどに対応。公式サイト Takara Bio受託解析サービスNGS、遺伝子解析、シーケンス関連の国内受託解析サービス。公式サイト NovogeneNGS Servicesライブラリー調製、全ゲノム、RNA-seq、メタゲノム、ターゲット解析などに対応。公式サイト BGI GenomicsNGS Services大規模ゲノム解析、RNA-seq、メタゲノムなどの受託解析サービス。公式サイト Charles RiverNGS Testing for Adventitious Agent DetectionGMP条件下で外来性ウイルス検出や細胞株特性解析に使われるNGSサービス。公式サイト ViruSureNGS Testing for Adventitious Agent DetectionGMP対応のNGS外来性因子検出サービス。既知・未知のウイルス、細菌、マイコプラズマなどの検出に使われる。公式サイト PathoQuestNGS-based Biosafety TestingNGSを用いたバイオセーフティ試験、外来性ウイルス検出、細胞治療・ワクチン・バイオ医薬品の品質試験に対応。公式サイト