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核酸定量蛍光色素試薬(RiboGreen/SYBR/GelRed等) のメーカー・製品一覧
核酸定量蛍光色素
核酸定量蛍光色素試薬は、RNAやdsDNAに特異的に結合して微量核酸を高感度・高選択に定量する色素やゲル染色剤です。LNPのmRNA含量・封入率測定やNGSライブラリQC、ゲルでの確認に用いられます。検出対象(RNA/dsDNA)の選択性と直線域、共存物質下での識別性が用途適合の判断点です。
選び方
まず用途で二分します。溶液中の濃度を数値で測る「定量キット」か、電気泳動ゲルでバンドを光らせる「染色色素」か。次に標的(dsDNA/RNA・一本鎖)と感度域、定量なら手持ち蛍光計(Qubit等)かプレートリーダーか、染色ならEtBr代替の安全性と観察光源(UV/青色LED)を確認します。
- 用途(定量/ゲル染色)
- 標的(dsDNA/RNA・ssDNA)
- 感度域・直線域
- 機器(蛍光計/プレート)
- EtBr代替・観察光源
代表的な製品迷ったらここから
Thermo Fisher ScientificQuant-iT RiboGreen RNA Assay KitLNPのmRNA含量・封入率測定の定番。広い直線域でRNAを超高感度に定量したい時に。RNAを特異的に検出する超高感度蛍光色素。マイクロプレートで1ng/mL〜1µg/mLの広い直線域。LNPのmRNA含量・封入率測定に多用される定番。公式情報 →
Thermo Fisher ScientificQubit dsDNA HS Assay Kitadd-and-readでdsDNAを高選択定量。NGSライブラリQCの標準を手早く回したい時に。二本鎖DNAを高選択に定量するQubitアッセイHS版。0.005〜120ng/µLに対応し、RNA・ssDNA・タンパク混在下でもdsDNAを識別。NGSライブラリQCの標準。公式情報 →
Thermo Fisher ScientificSYBR Gold Nucleic Acid Gel Stain結合で1000倍超に増強する最高感度クラス。RNA・ssDNA・変性ゲルまで一本でカバー。結合時に1000倍超の蛍光増強を示す最高感度クラスのゲル染色色素。dsDNA・ssDNA・RNAをEtBrの25〜100倍の感度で検出。変性ゲルにも対応。公式情報 →
BiotiumGelRed Nucleic Acid Gel StainEtBr代替の定番。膜非透過で変異原性が低く、UVで従来同様にバンドを確認できる。エチジウムブロマイド代替の赤色蛍光ゲル染色色素。膜非透過設計で変異原性が低く、UVでEtBr様の検出が可能。アガロース電気泳動の定番。公式情報 →
溶液定量キット(RNA/DNA)(6)
LNPのmRNA含量や原薬の濃度を数値で測りたい時に。標的を選んで高選択に定量。
Thermo Fisher ScientificQuant-iT RiboGreen RNA Assay KitRNAを特異的に検出する超高感度蛍光色素。マイクロプレートで1ng/mL〜1µg/mLの広い直線域。LNPのmRNA含量・封入率測定に多用される定番。公式情報
Thermo Fisher ScientificQubit RNA HS Assay KitQubitフルオロメーター用のadd-and-read RNA定量キット。DNA・タンパク・遊離ヌクレオチドと区別して低濃度RNAを高感度・高選択に定量。公式情報
Thermo Fisher ScientificQubit dsDNA HS Assay Kit二本鎖DNAを高選択に定量するQubitアッセイHS版。0.005〜120ng/µLに対応し、RNA・ssDNA・タンパク混在下でもdsDNAを識別。NGSライブラリQCの標準。公式情報
PromegaQuantiFluor ONE dsDNA System色素・標準ともadd-and-read形式で自動化に適したdsDNA定量システム(504nm Ex/531nm Em)。微量dsDNAを簡便・迅速に定量。公式情報
AAT BioquestStrandBrite Green Fluorimetric RNA Quantitation KitRNA選択的な緑色蛍光色素で5ng/mLレベルのRNAをプレートリーダー/フルオロメーターで定量。RiboGreenの代替として利用。公式情報
溶液定量キット(dsDNA高感度)(3)
NGSライブラリなど極微量のdsDNAを正確に測りたい時に。pgレベルの直線域。
BiotiumAccuGreen High Sensitivity dsDNA Quantitation KitQubit等ハンディフルオロメーター対応のdsDNA高感度定量キット。0.1〜100ng/tubeの直線域でRNAや夾雑物の影響を抑えdsDNAを選択定量。公式情報
BiotiumAccuBlue NextGen dsDNA Quantitation Kit約1〜3,000pgの超微量dsDNAをプレートリーダーで定量する最高感度クラスのアッセイ。NGS等の極微量DNA定量に対応。公式情報
AAT BioquestHelixyte Green Fluorimetric dsDNA Quantitation Kit (High Sensitivity)dsDNA選択的なHelixyte Green色素を用いた高感度定量キット。UV吸光より約1万倍高感度で、RNA・タンパク混在下でもdsDNAを定量。公式情報
ゲル染色色素(dsDNA/EtBr代替)(5)
アガロース電気泳動の定番。EtBrより安全で、UV/青色光でバンドを確認したい時に。
BiotiumGelRed Nucleic Acid Gel Stainエチジウムブロマイド代替の赤色蛍光ゲル染色色素。膜非透過設計で変異原性が低く、UVでEtBr様の検出が可能。アガロース電気泳動の定番。公式情報
Thermo Fisher ScientificSYBR Safe DNA Gel StainEtBrより安全なdsDNA向けゲル染色色素。青色光トランスイルミネーターで観察でき、UV被曝とDNA損傷を低減。公式情報
Takara BioSYBR Green I Nucleic Acid Gel Stain二本鎖DNA向けインターカレーター色素。254nm照射で20pg以下のdsDNAを検出でき、EtBrの25〜100倍の感度。アガロース/PAGEに対応。公式情報
ニッポンジーンMidori Green AdvanceEtBr代替の安全な核酸ゲル染色色素。dsDNA/ssDNA/RNAを高感度検出し、UVまたは青/緑LEDで観察可能。プレキャスト/ポスト染色対応。公式情報
ゲル染色色素(RNA/ssDNA・高感度)(4)
RNAや一本鎖、変性ゲルを高感度で見たい時に。S/N比とすそ感度が要る用途。
Thermo Fisher ScientificSYBR Gold Nucleic Acid Gel Stain結合時に1000倍超の蛍光増強を示す最高感度クラスのゲル染色色素。dsDNA・ssDNA・RNAをEtBrの25〜100倍の感度で検出。変性ゲルにも対応。公式情報
Takara BioSYBR Green II Nucleic Acid Gel StainRNA・一本鎖DNA向けの高感度ゲル染色色素。脱色操作不要でEtBrの2〜3倍の感度。アガロース/PAGEに対応。公式情報
LonzaGelStar Nucleic Acid Gel StaindsDNA/ssDNA/RNAを高感度に検出する蛍光色素。20pgのdsDNAまたは3ngのRNAを検出でき、S/N比に優れる。プレ/ポスト染色対応。公式情報
BiotiumGelGreen Nucleic Acid Gel StainEtBr代替の緑色蛍光ゲル染色色素。膜非透過で安全性が高く、青色光トランスイルミネーターに対応。dsDNA/ssDNA/RNAを染色。公式情報
日本市販・周辺試薬(3)
国内調達・短納期を優先したい時に。和光等経由で入手できる選択肢。
FUJIFILM WakoGelGreen / GelRed(取扱)Biotium製の安全な核酸ゲル染色色素を国内取扱。EtBr代替として変異原性を抑え、UV/青色光で核酸を可視化。国内調達に対応。公式情報
富士フイルム和光純薬SAFELOOK Green Nucleic Acid StainEtBr代替の安全な核酸ゲル染色色素。アガロースゲル電気泳動でDNA/RNAを高感度に可視化。国内メーカー製で和光経由でも入手可能。公式情報
PromegaQuantiFluor dsDNA SystemRNAやssDNAへの結合が少なくdsDNAを選択的に定量する蛍光色素システム(504nm Ex/531nm Em)。NGS等のDNA定量に適する。公式情報