Makers & Products
ペプチドマッピング用プロテアーゼ・消化酵素（MSグレード） のメーカー・製品一覧
ペプチドマッピング前処理
トリプシンやLys-Cなど、抗体のペプチドマッピングで配列特異的に切断するMSグレードの消化酵素です。一次構造確認やPTM解析の前処理工程で用い、自己消化や非特異切断の抑制がデータの清浄度を左右します。切断特異性とロットごとのMS適格性確認の有無を選定軸にするとよいでしょう。
選び方
ペプチドマッピング用の消化酵素は、まず質量分析（MS）グレードか（自己消化＝酵素が自分を分解した断片や、キモトリプシン由来の非特異切断が抑えてあるか）で土台が決まります。次に主役のトリプシンに何を足すか――切れにくい配列を埋める補完プロテアーゼ、ミスクリベージ（切り残し）を減らすLys-C混合、抗体を断片に分けるサブユニット酵素――を目的で選びます。再現性と速さを上げたいなら自動化・固定化キットも検討します。
- MSグレード（自己消化抑制）
- 特異性（Arg/Lys等）
- 補完／混合で網羅
- 抗体サブユニット対応
- 自動化・消化速度
代表的な製品迷ったらここから
PromegaSequencing Grade Modified Trypsin自己消化とキモトリプシン活性を抑えた定番。Arg/Lysを高特異に切る最初の一本に。還元メチル化で自己消化を抑えTPCK処理でキモトリプシン活性を除去した定番のシーケンスグレードトリプシン。Arg/Lys C末端を高特異的に切断し、プロテオミクスのde facto標準。公式情報 →
WatersRapiZyme Trypsin高熱安定・自己消化耐性で1:5・30分の高速消化。抗体マップを清浄に短時間で。均一メチル化した組換えブタトリプシン。高い熱安定性と自己消化耐性で酵素:基質比1:5・30分の高速消化を可能にし、抗体ペプチドマップを清浄化。公式情報 →
PromegaTrypsin/Lys-C Mix, Mass Spec Grade切り残しを抑え同定数・定量再現性を底上げ。網羅性を上げたい時の定番混合。Trypsin GoldとrLys-Cを最適配合した混合試薬。変性・非変性いずれの溶液内消化でも切断完全性を高め、同定ペプチド数と定量再現性を向上。公式情報 →
GenovisFabRICATOR (IdeS)IgGを一箇所で切りF(ab')2/Fc-2に。middle-up/down解析の標準試薬。IgGヒンジ下を一箇所で切断するシステインプロテアーゼ。均一なF(ab')2とFc/2断片を生成し、middle-up/middle-down LC-MSによる抗体特性解析の標準試薬。公式情報 →
トリプシン（MSグレード）（10）
まず主役を選ぶ。自己消化と非特異切断が抑えてあるか、消化の速さ・再現性で。
PromegaSequencing Grade Modified Trypsin還元メチル化で自己消化を抑えTPCK処理でキモトリプシン活性を除去した定番のシーケンスグレードトリプシン。Arg/Lys C末端を高特異的に切断し、プロテオミクスのde facto標準。公式情報
PromegaTrypsin Gold, Mass Spectrometry Grade各ロットをMSで適格性確認したMS用トリプシン。ゲル内・溶液内消化の双方に対応し、自己消化耐性とArg/Lys特異性を両立。公式情報
PromegaTrypsin Platinum, Mass Spectrometry Grade組換えトリプシンを独自修飾し自己消化ピークをほぼ排除。キモトリプシン由来の非特異切断がなくRP-HPLC-UV/MSの抗体ペプチドマッピングを清浄化。公式情報
Thermo Fisher ScientificPierce Trypsin Protease, MS Gradeブタ膵由来をTPCK処理・メチル化修飾したMSグレードトリプシン。高活性で安定、抗体・タンパク質のペプチドマッピング前処理に広く使われる。公式情報
MerckSOLu-Trypsin（組換え・溶液安定型）組換えトリプシン（ブタ配列）を溶液安定化したAdvanced Proteomics Grade。冷蔵で長期安定し再溶解不要、キモトリプシン活性フリーで高再現性。公式情報
MerckTrypsin Singles, Proteomics Gradeブタ膵由来を還元メチル化・TPCK処理で自己消化と非特異活性を抑えた個包装トリプシン。高い配列カバレッジを狙うプロテオミクス用。公式情報
Roche / MerckTrypsin Sequencing Grade（modified, bovine）ウシ膵由来のシーケンスグレード修飾トリプシン（Roche製、Sigma経由で供給）。MS互換のペプチドマッピング・タンパク質同定に用いる。公式情報
Worthington BiochemicalTrypsin, TPCK Treated / SequENZ TrypsinTPCK処理でキモトリプシン活性を抑え自己消化物を精製除去したトリプシン。SequENZは自己消化を低減した化学修飾品で長時間消化に適する。公式情報
FUJIFILM WakoTrypsin, from Porcine Pancreas, Mass Spectrometry Gradeブタ膵由来のMSグレードトリプシン。ゲル内消化やPTM解析向けに精製され、国内調達しやすい日本メーカー品。公式情報
Lys-C・トリプシン/Lys-C混合（5）
切り残し（ミスクリベージ）を減らし配列の網羅を上げたい時に。逐次・併用で完全消化へ。
PromegaLys-C, Mass Spec Grade（rLys-C含む）Lysobacter由来のMSグレードLys-C。Lys C末端を高特異的に切断し、Lys-Proも切れるためトリプシンとの逐次消化でミスクリベージを低減。組換え版rLys-Cも提供。公式情報
PromegaTrypsin/Lys-C Mix, Mass Spec GradeTrypsin GoldとrLys-Cを最適配合した混合試薬。変性・非変性いずれの溶液内消化でも切断完全性を高め、同定ペプチド数と定量再現性を向上。公式情報
Thermo Fisher ScientificPierce Trypsin/Lys-C Protease Mix, MS GradeトリプシンとLys-Cを凍結乾燥で混合したMSグレード試薬。消化効率を高めミスクリベージを抑え、抗体・複雑試料のLC-MS前処理に適する。公式情報
FUJIFILM WakoLysyl Endopeptidase, Mass Spectrometry Grade (Lys-C)Achromobacter由来Lys-C（リシルエンドペプチダーゼ）のMSグレード品。凍結乾燥で活性を保持し、ゲル内消化やトリプシン前段消化に用いる国内定番。公式情報
補完プロテアーゼ（Glu-C/Asp-N/Arg-C/キモトリプシン）（5）
トリプシンだけで埋まらない配列・PTM領域を別の切断パターンで補完したい時に。
PromegaGlu-C, Sequencing GradeGlu C末端側を特異的に切断する血清プロテアーゼ（リン酸緩衝液中ではAspも）。トリプシン単独で得にくい配列領域を補完しカバレッジを上げる。公式情報
PromegaAsp-N, Sequencing GradeAsp N末端側を切断するエンドプロテイナーゼ。pH4-9で活性を持ち、相補的な切断パターンでペプチドマッピングのカバレッジ補完に用いる。公式情報
PromegaArg-C Ultra, Mass Spec GradeArg C末端側を切断するMSグレードArg-C。トリプシンより大きいペプチドを生じ、相補的消化でPTM解析や配列確認を補強。公式情報
PromegaChymotrypsin, Sequencing Grade芳香族アミノ酸（Tyr/Phe/Trp）のC末端側を切断するウシ膵由来エンドプロテイナーゼ。トリプシン難切断領域の補完に有効。公式情報
Worthington BiochemicalChymotrypsin / Endo-Glu-C / Endo-Arg-C（プロテオミクス用）プロテオミクス・タンパク質シーケンス向けに特別包装した補完プロテアーゼ群。トリプシンと組み合わせ多重消化で配列カバレッジを拡張。公式情報
抗体サブユニット消化酵素（IdeS/IgG特異）（4）
抗体をFab/Fcなど大きな断片に分けてmiddle-up/down解析する時に。
GenovisFabRICATOR (IdeS)IgGヒンジ下を一箇所で切断するシステインプロテアーゼ。均一なF(ab')2とFc/2断片を生成し、middle-up/middle-down LC-MSによる抗体特性解析の標準試薬。公式情報
GenovisGingisKHAN（IgG1特異プロテアーゼ）IgG1ヒンジ上を切断し無傷のFabとFcを生成する酵素。FabRICATORと併用してサブユニット解析の総配列カバレッジを高める。公式情報
PromegaIdeS Protease / IdeZ Protease抗体ヒンジ下を切断するIgG特異プロテアーゼ。F(ab')2/Fc断片を生じ、治療用抗体のmiddle-down LC/MS特性解析に用いる。公式情報
固定化酵素・自動化消化キット（2）
速く・再現性高く消化したい、前処理を自動化したい時に。