用語集
「ペプチドマッピング」とは？
タンパク質を断片に切り分け、どこがどれだけ化学変化したかを調べる分析。
タンパク質を断片に切り分け、どこがどれだけ化学変化したかを調べる分析。
ペプチドマッピングとは、タンパク質やペプチド医薬を酵素消化で断片化し、一次構造・ジスルフィド架橋・部位ごとの化学修飾を読み解く分析手法です。分子全体の質量を測るインタクト質量分析では見えない「どの残基が・どう変化しているか」を部位レベルで突き止められるため、同一性の裏づけや規格設定の前提として欠かせない位置づけにあります。
全長のまま質量を測るインタクト質量分析は分子全体の概要をつかむのに適していますが、どの残基がどう変化したかという部位レベルの情報は得られません。ペプチドマッピングは酵素消化とMS/MSを組み合わせることで、その解像度を残基単位まで引き上げます。両者は対立する手法ではなく、インタクト質量で全体像を確認したうえで、必要に応じてペプチドマッピングで詳細を掘り下げるという使い分けがなされます。分子が大きく修飾が増えるほど、この二段階のアプローチが重要になります。
ペプチドマッピングが担う役割は広く、同一性の確認、ジスルフィド架橋が正しく形成されているかの検証、C-ペプチド切断や末端処理が意図どおりかの部位ごとの確認、そして不純物の正体を突き止めることまで及びます。「何が・どこに・どれだけ」を明らかにすることが規格設定の前提とされており、LC-MSやRP-HPLCといった他の分析手法と役割を分担しながら、多層的な品質評価の中核を担っています。
この定義はProglenth編集部が一般的・基礎的な内容として整理したものです。実際の管理基準・要件は製品・企業・各極の規制により異なります。 正確な運用は各極の薬局方・ガイドライン（ICH／GMP等）やメーカーの一次情報をご確認ください。