選び方 — Harvest & Clarification

ハーベスト・清澄化の選び方

取りたいものは上清か、細胞の中身か、細胞そのものか——そのうえで固液分離をどこに置くか?

ハーベストと清澄化は、目的物が上清にあるのか細胞の中に溜まるのか、それとも細胞そのものが製品なのかで、工程の向きごと変わります。同じ「清澄化」という言葉でも、分泌型の培養液と細胞内蓄積の発酵液では通る道具立てが違います。まず何を処理するのかで分岐し、その内側で固液分離をどこに置くかを決める、という順にたどります。

培養や発酵を終えた液には、目的物と一緒に細胞・デブリ・核酸が入っています。清澄化はそれを下流に渡せる状態にする工程ですが、装置構成は一つに決まりません。上清を澄ませれば済む場合もあれば、細胞を集めて壊し、粘度の上がった溶解液を相手にする場合もあります。しかも上流の終了条件が動けば負荷そのものが変わるため、清澄化は培養側の条件が固まってから詰める工程になります。

選ぶときに見る軸

目的物の所在上清にあるのか、細胞内に蓄積するのか、細胞そのものが製品なのか。ここで工程の向きが決まり、以降の軸の意味も変わる。
原料の素性哺乳細胞か微生物か、付着系か浮遊系か。固形分量と粘度が違えば、同じ道具立てはそのまま通らない。
培養の運転方式回分・流加で一度に受けるか、灌流で連続に抜き続けるか。灌流では一次清澄化の担い手が細胞保持デバイス側へ移る。
固液分離をどこに置くか遠心を先に置いて負荷を下げるか、ろ材だけで受けるか。設備側の負担と消耗品費の配分が変わり、使い捨て流路の遠心という中間解もある。
核酸・デブリの負荷生存率が下がるほど、また破砕を挟むほど、遊離核酸と微細デブリが増えて粘度も上がる。ヌクレアーゼ処理や凝集を前提に置くかは、この見積りから決まる。
接続の閉じ方無菌接続で流路を閉じるか、開放操作を許して環境側で担保するか。閉鎖系かどうかはシングルユースかステンレスかとは別の軸で、ステンレスでも閉鎖系は成立する。

選択肢と、なぜそれを選ぶか

1

上清を、ろ過だけで受ける

分泌型・多品種/流路を閉じたい

一次清澄化をろ材に丸ごと担わせる構成です。回転機がないぶん流路を無菌接続で閉じやすく、洗浄バリデーションの負担も軽くなりますが、E&Lの評価や使用前後の完全性確認まで消えるわけではありません。濁質の負荷はすべてろ材に来るため、面積と消耗品費はこちらのほうが大きく出ます。

注意:必要面積は理論からは出ない。同じろ材の小型デバイスに実液を流して面積あたりの処理量を出し、ロット間変動を見込んだ余裕を掛けて設計する。ただし面積を積むほど吸着・ホールドアップ・フラッシュ量も増え、回収率が削られる。

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2

遠心で負荷を下げ、ろ過で仕上げる

分泌型・大容量を繰り返し流す

先に細胞塊を落としてからろ過する二段構成で、ろ材の必要面積を大きく減らせます。バッチを重ねるほど、消耗品費の差が設備側の負担を上回ってきます。ただし遠心はろ過の代わりにはならず、微粒子を取り切る後段は残ります。

注意:回転機を持つ=洗浄とSIPを引き受ける、とは限らない。使い捨て流路の連続遠心もあり、設備投資と消耗品費の分け方はもう二択ではない。入口や排出部のせん断で細胞が壊れれば、除きたかった核酸とHCPがかえって増える点は構成を問わず共通。

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3

灌流で、一次清澄化を上流に移す

培養と回収を止めずに回す

バッチの終わりに一度で受けるのではなく、培養中に薄いハーベスト液を出し続ける構成です。一次清澄化を担うのは後段のろ過や遠心ではなく細胞保持デバイスになり、清澄化の設計がそのまま上流の運転設計に食い込みます。受け側の容器容量と下流の処理速度をどう合わせるかが設計対象になります。

注意:最大の論点は、運転が進むにつれて目的物の透過(シービング)が落ち、回収率の劣化として表れること。保持デバイス自体の選定軸は灌流運転側の話題なので、TFF膜・バイオリアクターの選び方と併せて見るほうが早い。

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4

細胞を集め、壊してから清澄化する

細胞内蓄積の発現系/溶解を伴うベクター

微生物発現系の多くは目的物が細胞内に溜まるため、回収すべきは上清ではなく菌体側で、破砕して初めて目的物が液側へ移ります。破砕液は微細な破片と遊離核酸で粘度が上がり、ろ材はすぐ詰まるので、ヌクレアーゼ処理や凝集で負荷を落としてから固液分離に渡すのが定石です。細胞を溶解して回収するタイプのウイルスベクターも、向きは違っても同じ問題に当たります。

注意:同じ微生物でも分泌型なら向きが反転し、固形分を落として膜で仕上げる流れになる。原料の種類ではなく目的物の所在で決める。凝集剤・ろ過助剤・ヌクレアーゼはいずれも下流に残留物の管理を持ち込むため、除去の見通しまで含めて選ぶ。

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5

細胞のほうを回収する(細胞治療)

細胞そのものが製品になる

捨てるのが上清で、取るのが細胞という逆向きの工程です。回収率・処理後の生存率・流路を閉じられるかという論点は抗体側と共通しますが、コストの数え方が変わり、装置本体の価格より1ロットあたりの使い捨てキット単価と占有時間で比べることになります。自家製品では1ロット=1患者なので、スループットという言葉の意味そのものが違います。

注意:研究用の小型分離器具や汎用の卓上遠心と、閉鎖系のまま回せるGMP機器は層が違う。同じ「細胞を分ける」でも、無菌接続で流路を閉じられるかどうかで候補はかなり絞られる。

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セットで見る分析・品質試験

宿主細胞タンパク質(HCP)HCP(宿主細胞由来タンパク質)とは?清澄化はHCPを減らす工程でもあり、増やす工程にもなりえます。せん断や破砕で細胞を余計に壊していないか、電荷ろ材の低減効果が実液で出ているかは、ここに表れます。残存DNA残存DNAとは?死細胞や破砕から出る遊離核酸は、ろ材の目詰まりと下流の負荷を同時に押し上げます。ヌクレアーゼ処理を入れた/入れない条件の妥当性を、濁度ではなく数値で確かめる項目です。工程由来不純物の残留工程由来の残存不純物とは?(dsRNA・鋳型DNA・酵素・ビーズ)ヌクレアーゼ・凝集剤・ろ過助剤は、負荷を下げる代わりに自分自身が管理対象になります。使うと決めた時点で、どこまで下げられるかの見通しをセットで持っておきます。力価・濃度(回収率)力価・濃度とは?面積・ホールドアップ・フラッシュ設計の代償は回収率として出ます。灌流では運転経過に伴う透過の低下も同じ指標に表れるため、清澄化前後だけでなく時間軸でも押さえておきます。細胞の生存率・表現型(細胞治療側)フローサイトメトリーによる細胞特性解析とは?細胞を回収する工程では、取れた量だけでなく処理後に生きているか・性質が変わっていないかが成否です。装置と条件の選定は、この結果とセットで判断します。

この判断を支える解説記事

深掘りハーベスト・清澄化の解説(抗体を軸に)

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